Cícero Carlos de Souza Almeida

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Produções bibliográficas

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• TERTO, JACKELINE ; MAIA, ANA KELLY ; CHAVES, LÁZARO JOSÉ ; JÚNIOR, JOSUÉ FRANCISCO SILVA ; VEASEY, ELIZABETH ANN ; SILVA, EDSON FERREIRA ; Almeida, Cícero . The genetic structure of Hancornia speciosa (Apocynaceae) reveals two botanical varieties. PLANT SYSTEMATICS AND EVOLUTION , v. 310, p. 1-1, 2024.

• DE MELO, SUZYANNE MORAIS FIRMINO ; MARQUES, ANDRÉ ; Almeida, Cícero . The mitochondrial genome sequence of Syagrus coronata (Mart.) Becc. (Arecaceae) is characterized by gene insertion within intergenic spaces. Tree Genetics & Genomes , v. 20, p. 10-10, 2024.

• MAIA, A. K. S. ; TERTO, J. ; Oliveira IF ; NASCIMENTO, W. F. ; Almeida, C. ; SILVA, E. F. . Genetic diversity and structure of Hancornia speciosa Gomes populations characterized by microsatellites markers. Crop Breeding and Applied Biotechnology , v. 22, p. 1-8, 2022.

• HOFSTATTER, PAULO G. ; THANGAVEL, GOKILAVANI ; LUX, THOMAS ; NEUMANN, PAVEL ; VONDRAK, TIHANA ; NOVAK, PETR ; ZHANG, MENG ; COSTA, LUCAS ; CASTELLANI, MARCO ; SCOTT, ALISON ; TOEGELOVÁ, HELENA ; FUCHS, JOERG ; MATA-SUCRE, YENNIFER ; DIAS, YHANNDRA ; VANZELA, ANDRÉ L.L. ; HUETTEL, BRUNO ; ALMEIDA, CICERO C.S. ; ?IMKOVÁ, HANA ; SOUZA, GUSTAVO ; Pedrosa-Harand, Andrea . Repeat-based holocentromeres influence genome architecture and karyotype evolution. CELL , v. 185, p. 3153-3168.e18, 2022.

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• OLIVEIRA, MARIA ALICE SILVA ; NUNES, TOMÁZ ; DOS SANTOS, MARIA APARECIDA ; FERREIRA GOMES, DANYELLE ; COSTA, IARA ; VAN-LUME, BRENA ; MARQUES DA SILVA, SARAH S. ; OLIVEIRA, RONALDO SIMÃO ; SIMON, MARCELO F. ; LIMA, GAUS S. A. ; GISSI, DANILO SOARES ; Almeida, Cícero Carlos de Souza ; SOUZA, GUSTAVO ; MARQUES, ANDRÉ . High-Throughput Genomic Data Reveal Complex Phylogenetic Relationships in Stylosanthes Sw (Leguminosae). Frontiers in Genetics , v. 12, p. 1-18, 2021.

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• OLIVEIRA, M. A. S. ; FERREIRA, D. ; NUNES, J. T. F. ; Almeida, Cícero Carlos de Souza ; MARQUES, A. S. . MONTAGEM E COMPARAÇÃO DOS GENOMAS PLASTIDIAIS DO COMPLEXO STYLOSANTHES SCABRA E DO COMPLEXO S. CAPITATA (LEGUMINOSAE). In: XXII Encontro de Genética do Nordeste, 2018, Natal. ANAIS DO XXII ENCONTRO DE GENÉTICA DO NORDESTE, 2018. p. 216.

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• ALMEIDA, C. C. S. ; CARVALHO, Paulo Cesar de Lemos ; GUERRA, Marcelo . Avaliação citogenética da suposta origem híbrida de umbu-cajá por meio de coloração CMA/DAPI, FISH e GISH. In: 51º Congresso Brasileiro de Genética 51º Congresso Brasileiro de Genética, 2005, Águas de Lindóia. Resumos do 51º Congresso Brasileiro de Genética, 2005.

• PEDROSA-HARAND, A. ; ALMEIDA, C. C. S. ; MOSIOLEK, Magdalena ; KAMI, James ; GUERRA, Marcelo ; SCHWEIZER, Dieter . cytogenetic-based physical mapping of common bean. In: Plant & Animal Genome XIII, 2005, San Diego. Plant & Animal Genome XIII, 2005. v. 2005.

• HARAND, Andrea Pedrosa ; ALMEIDA, C. C. S. ; KAMI, James ; SCHLÖGELHOFER, Peter ; GEPTS, Paul ; SCHWEIZER, Dieter ; GUERRA, Marcelo . Cytogenetics-based physical mapping of common bean. In: Phaseomics III, 2004, Geneva. Phaseomics III, 2004. p. 2-2.

• ALMEIDA, C. C. S. ; HARAND, Andrea Pedrosa ; GUERRA, Marcelo . Sítios de DNAr 5S e 45S variam amplamente dentro de Phaseolus vulgaris, mas se mantém estáveis em Phaseolus lunatus: um estudo em 26 cultivares. In: 50° Congresso Brasileiro de Genética, 2004, Florianópolis. Resumos do 50° Congresso Brasileiro de Genética, 2004. p. 140-140.

• ALMEIDA, C. C. S. ; AMORIM, Edson Perito ; SERENO, Maria Jane Cruz de Melo ; BARBOSA NETO, José Fernandes . Efeito de Desidratante e Temperatura na Estocagem de Polén de Milho (Zea mays L.). In: XXIV Congresso Nacional de Milho e Sorgo, 2002, Florianópolis. XXIV Congresso Nacional de Milho e Sorgo. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2002. p. 480-480.

• AMORIM, Edson Perito ; ALMEIDA, C. C. S. ; SERENO, Maria Jane Cruz de Melo ; BARBOSA NETO, José Fernandes . Variabilidade Genética em Milho Doce Estimada Através de Marcadores MolecularesMicrossatélites. In: XXIV Congresso Nacional de Milho e Sorgo, 2002, Florianópolis. XXIV Congresso Nacional de Milho e Sorgo. sete lagoas: Embrapa milho e sorgo, 2002. p. 69-69.

• AMORIM, Edson Perito ; ALMEIDA, C. C. S. ; SERENO, Maria Jane Cruz de Melo ; BARBOSA NETO, José Fernandes . Variabilidade Genética em Milho Doce Estimada Através de Caracteres Morfológicos, RAPD eMicrossatélites. In: XXIV Congresso Nacional de Milho e Sorgo, 2002, Florianópolis. XXIV Congresso Nacional de Milho e Sorgo. sete lagoas: Embrapa milho e sorgo, 2002. p. 68-68.

• AMORIM, Edson Perito ; ALMEIDA, C. C. S. ; SERENO, Maria Jane Cruz de Melo ; BARBOSA NETO, José Fernandes . Diversidade Genética Entre Genótipos de Milho Doce Estimada Por Meio de Marcadores RAPD. In: XXIV Congresso Nacional de Milho e Sorgo, 2002, Florianópolis. XXIV Congresso Nacional de Milho e Sorgo. Sete Lagoas: Embrapa milho e sorgo, 2002. p. 54-54.

• AMORIM, Edson Perito ; ALMEIDA, C. C. S. ; SERENO, Maria Jane Cruz de Melo ; BARBOSA NETO, José Fernandes ; VOLTZ, A. W. . Divergência Genética entre Genótipos de Milho Doce Utilizando Caracteres Agronômicos. In: 46ª Reunião Técnica Anual do Milho 29ª Reunião Anual do Sorgo, 2001, Porto Alegre, 2001.

• ALMEIDA, C. C. S. ; ESPÍNDOLA, Alice Calheiros de Melo ; CARVALHO, Noêmia Schwartz Gama de ; SILVA, C. A. . Efeito de NPK em plantas jovens de mangabeira (Hancornia speciosa Gomes) sob cultivo em áreas de tabuleiros costeiros. In: X Encontro de Iniciação Científica da Universidade Federal de Alagoas, 2000, Maceió. X Encontro de Iniciação Científica da Universidade Federal de Alagoas, 2000.

• SILVA, I. J. ; ESPÍNDOLA, Alice Calheiros de Melo ; SANTOS, V. R. ; ALMEIDA, C. C. S. . Influência de fontes de fósforo no crescimento de plantas jovens de mangabeira (Hancornia speciosa Gomez). In: X Encontro de Iniciação Científica da Universidade Federal de Alagoas, 2000, Maceió. X Encontro de Iniciação Científica da Universidade Federal de Alagoas, 2000.

• ALMEIDA, C. C. S. ; ESPÍNDOLA, Alice Calheiros de Melo ; SILVA, C. A. . Estudo Fenológicos da mangabeira (Hancornia speciosa Gomez) sob cultivo em áreas de tabuleiro no estado de Alagoas. In: X Encontro de Iniciação Científica da Universidade Federal de Alagoas, 2000, Maceió. X Encontro de Iniciação Científica da Universidade Federal de Alagoas, 2000.

• ALMEIDA, C. C. S. ; ESPÍNDOLA, Alice Calheiros de Melo . Estudo Fenológicos da mangabeira (Hancornia speciosa Gomez) sob cultivo em áreas de tabuleiro no estado de Alagoas. In: 52ª Reunião Anual da SBPC, 2000, Brasília. 7ª Jornada de Iniciação Científica, 2000.

• ALMEIDA, C. C. S. ; ESPÍNDOLA, Alice Calheiros de Melo . Estudo Fenológicos da mangabeira (Hancornia speciosa Gomez) sob cultivo em áreas de tabuleiro no estado de Alagoas. In: IX Encontro de Iniciação Científica da Universidade Federal de Alagoas, 1999, Maceió, 1999.

• ALMEIDA, C. C. S. . VARIABILIDADE GENÉTICA EM ACESSOS DE CANA-DE-AÇÚCAR (Saccharum spp.) ESTIMADA POR MEIO DE MARCADORES MOLECULARES MICROSSATÉLITES (SSR). 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ALMEIDA, C. C. S. . USO DE MARCADORES MOLECULARES MICROSSATÉLITES (SSR) PARA IDENTIFICAÇÃO DE ACESSOS DE CANA-DE-AÇÚCAR (Saccharum spp.). 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Projetos de pesquisa

• 2017 - Atual

  Genômica comparativa em espécies neotropicais do gênero Spondias (Anacardiaceae), Descrição: O presente projeto tem como objetivo realizar um extenso estudo de genética, genômica e transcriptômica em espécies nativas do gênero Spondias (Anacardiaceae). Essas espécies são negligenciadas no âmbito acadêmico, entretanto, são de elevada importância econômica e social para a região do Nordeste do Brasil, pelo fato de serem utilizadas tanto para consumo humano como para a produção de produtos típicos da região Nordeste. O estudo a ser realizado terá uma abordagem genômica e transcriptômica, utilizando elevada quantidade de dados provenientes do sequenciamento de DNA e RNA, através da Tecnologia de Nova Geração. Os grupos taxonômicos serão quantificados os tamanhos dos genomas usando citometria de fluxo, serão desenvolvidas e sequenciadas três bibliotecas de DNA (mate-paried, singles read e paired-end) usando a plataforma Illumina HiSeq2500. Esses dados permitirão desenvolver marcadores microssatélites para estudos de genética de populações, sequenciamento do genoma de cloroplastos e mitocondrial, análise do transcriptoma com identificação dos principais genes que caracterizam o gênero e serão desenvolvidos ?draft genomes? (rascunho dos genomas) para as espécies Spondias tuberosa e Spondias mombin. Esses resultados serão analisados no contexto evolutivo e descritivos dos genomas. Deve-se enfatizar que serão sequenciadas bibliotecas de RNA (RNA-seq), que possibilitará estudar os genes e como essas plantas sobrevivem em condições de severo estresse hídrico, contribuindo para futuros estudos em melhoramento genético. As atividades metodológicas serão desenvolvidas na Universidade Federal de Alagoas e em outros laboratórios parceiros, sendo a quantificação do tamanho dos genomas feita na Universidade Federal de Pernambuco e o sequenciamento de DNA será realizado no Laboratório Central de Tecnologias de Alto Desempenho em Ciências da Vida (LaCTAD), localizado na Universidade Estadual de Campinas. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Cicero Carlos de Souza Almeida - Coordenador / Eliane Paz Balbino - Integrante / Jackeline Terto - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2016

  Desenvolvimento de marcadores moleculares microssatélites (SSR) e análise genética populacional em Myracrodruon urundeuva Fr. Allemão, Descrição: A Caatinga é o principal bioma do Nordeste do Brasil e apresenta espécies vegetais endêmicas. É um ecossistema bastante biodiversificado, entretanto pouco estudado e afetado por vários impactos sócio-ambientais, promovidos por ações antrópicas, sendo a agropecuária, a construção de estradas e barragens, o extrativismo e a urbanização que contribuem de maneira substancial para o desmatamento da caatinga, promovendo a degradação do ambiente, especialmente na bacia do Rio São Francisco. A devastação contribui também para a redução ou extinção espécies de vegetais nativos, que na maioria das vezes ainda são pouco conhecidos. Todo esse processo tem causado a desertificação de uma imensa área da caatinga, e em particular, nas vegetações do Estado de Alagoas, em que se estima uma redução da área original da caatinga em 89,5%, situação alarmante e passível de ações estratégicas emergenciais. Entre as espécies, cita-se a aroeira do sertão (M. urundeuva) como uma das espécies vulneráveis a extinção, onde tem diminuído de forma significativa o número de indivíduos e populações naturais, principalmente por ser uma espécies explorada na medicina popular e como madeira de lei. Nesse sentido, o desenvolvimento de marcadores moleculares, permitirá estudos de diversidade genética populacional e possibilitar traçar estratégias de preservação da espécie.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Cicero Carlos de Souza Almeida - Coordenador / Jose Vieira Silva - Integrante / Flávia Moura - Integrante.

• 2011 - 2015

  Fisiologia e Genética da Cana-de-açúcar para tolerência à seca, Descrição: Definir os descritores fisiológicos e genéticos que revelarão os genótipos contrastantes e os mecanismos que permitem os mesmos tolerar à seca. Analisar o comportamento dos descritores fisiológicos da cana-de-açúcar submetida a diferentes níveis de estresse hídrico, a fim de promover a expressão gênica diferencial dos genótipos, de maneira a permitir a identificação dos genes da tolerância à seca, a partir dos RNAs diferencialmente transcritos. Usar esses genes para introdução direta em genótipos de cana-de-açúcar.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Cicero Carlos de Souza Almeida - Coordenador.

• 2011 - 2015

  Análise genética populacional de Syagrus coronata (Mart.) na região do baixo São Francisco, Descrição: O bioma Caatinga representa cerca de 70% da região Nordeste e 11% do território brasileiro, abrangendo os estados da Bahia, Sergipe, Alagoas, Pernambuco, Paraíba, Rio Grande do Norte, Ceará, Piauí e Minas Gerais. Entre as espécies nativas da Caatinga, destaca-se o Ouricuri, palmeira de elevada importância da região semi-árida brasileira. É empregada na alimentação humana e animal, artesanato e utensílios domésticos e na indústria. Nos últimos anos, a palmeira de Ouricuri vem sofrendo degradações significativas em suas populações nativas devido a práticas inadequadas de manejo e extrativismo dessa espécie. Estudos relacionados com a estrutura genética de populações nativas da caatinga são fundamentais para conhecer como as populações estão estruturadas geneticamente estabelecendo assim, planos de conservação e manejo apropriado, buscando a preservação das espécies e do ecossistema. Marcadores moleculares têm sido utilizados como ferramentas em estudos de genética de populações, gerando informações sobre a variabilidade genética de espécies nativas e cultivadas, taxonomia, identificação de indivíduos e em hipóteses filogenéticas. O processo de obtenção desses marcadores inicia-se com a extração e digestão do DNA genômico com enzima de restrição EcoRI, o produto da digestão será ligado a adaptadores, hibridizados e clonados no vetor de plasmídeo. As colônias brancas serão isoladas e individualizadas em microplacas (96 poços) contendo o meio de parada seletivo contendo glicerol, sendo posteriormente estocadas a -80º. Os marcadores obtidos serão avaliados nos indivíduos de Ouricuri. Assim, objetivou-se com este trabalho analisar a diversidade genética e populacional de Syagrus coronata do baixo São Francisco, usando marcadores moleculares SSR. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Cicero Carlos de Souza Almeida - Coordenador / Jose Vieira Silva - Integrante / Flávia Moura - Integrante.

• 2011 - Atual

  Análise genética da indentificar genes associados as componentes da própolis vermelha, Descrição: Analisar dos descritores fisiológicos e genéticos que definirão os genótipos a expressão gênica dos compostos da própolis vermelha Isolar RNAs diferencialmente transcritos em indivíduos de Dalbergia ecastophyllum, com intuito de obter genes associados aos componentes da própolis vermelha. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Cicero Carlos de Souza Almeida - Coordenador / Julio Cesar Andrade - Integrante.

• 2008 - 2009

  Identificação de genes para estresse hídrico em cana-de-açúcar através da Hibridização Subtrativa Supressiva (SSH)., Descrição: Analisar por meio de expressão diferencial genes para estresse hídrico em cana-de-açúcar. Será utilizada a estratégia de hibridização subtrativa supressiva.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Cicero Carlos de Souza Almeida - Coordenador / Tiago Barros Andrade - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Auxílio financeiro.

• 2007 - 2014

  Diversidade Genética nos principais acessos de cana-de-açúcar, avaliada por meio de marcadores moleculares do tipo Microssatélite (SSR), Descrição: A cana-de-açúcar tem papel importante na agricultura do nordeste brasileiro. O melhoramento genético tem contribuído para o rendimento desta cultura de forma significativa, com o desenvolvimento de variedades adaptadas as condições edafoclimáticas da região Nordeste do Brasil. Na Universidade Federal de Alagoas, o PMGCA (Programa de Melhoramento Genético da Cana-de-Açúcar-RIDESA) tem desenvolvido importantes variedades, cultivadas em várias regiões do Brasil. Essas variedades são obtidas por meio de cruzamentos na Estação de Floração e Cruzamentos Serra do Ouro (UFAL), que contém mais de 2.450 acessos. No melhoramento genético, o sucesso no desenvolvimento de uma variedade depende da existência de variabilidade genética no banco de germoplasma. Marcadores moleculares do tipo microssatélites (SSR),estão sendo obtidos a partir do genoma cana-de-açúcar, com intuito de classificar os genótipos em grupos, facilitando a escolha dos pais para cruzamentos artificiais, para diversas características.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Cicero Carlos de Souza Almeida - Coordenador.

• 2007 - 2012

  Constituição genômica de cana-de-açúcar, determinada por hibridização fluorescente in situ (FISH) de seqüências de DNA repetitivo, Descrição: Cultivares de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) são híbridos oriundos das espécies S. officinarum (x= 10, 2n = 8x = 80) e S. spontaneum (x = 8, 2n = 5-16x = 40-128). Essas cultivares apresentam de 100 a 130 cromossomos, sendo que 80-85% são derivados de S. officinarum, de 10-15% de S. spontaneum e 5-10% são recombinantes entre as duas espécies. Estudos têm indicado que a freqüência de bivalentes nesses híbridos prevalece, porém, diversas irregularidades meióticas têm sido encontradas, levando a uma alteração na formação de novas progênies, tais como aumento da freqüência de aneuplóides. Este projeto tem como objetivo principal isolar e localizar seqüências de DNA repetitivo específicas das espécies S. officinarum e S. spontaneum nos principais híbridos de cana-de-açúcar, a fim de determinar as proporções das espécies nos híbridos e compreender as relações evolutivas entre as espécies. Para isso, seqüências repetitivas de S. officinarum e S. spontaneum serão isoladas e hibridizadas in situ através de hibridização fluorescente in situ (FISH).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Cicero Carlos de Souza Almeida - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2007 - 2012

  Desenvolvimento de um sistema de marcadores citogenético molecular para o desenvolvimento de variedade de cana-de-açúcar, Descrição: As variedades desenvolvidas pela RIDESA possuem a sigla RB (República do Brasil), que atualmente ocupam mais 3,5 milhões de hectares plantados em todo o Brasil. O banco Serra do Ouro é gerenciado pela UFAL, o qual está localizado na estação de floração e cruzamento Serra do Ouro, no município de Murici-AL, que pela localização geográfica apresenta um profuso florescimento natural das diversas espécies e híbridos. O desenvolvimento dessas variedades tem proporcionado grandes avanços no incremento da produção com o desenvolvimento de novas materias mais adaptadas aos variados ambientes de cultivo. Essas variedades são obtidas através de cruzamentos artificiais entre diversos acessos, os quais são oriundos de diversas gerações de cruzamentos entre híbridos originários das espécies S. officinarum e S. spontaneum. O genoma de S. officinarum contribui com as características ?nobres?, como teor de sacarose, já a espécie S. spontaneum contribui com a rusticidade, de suma importância para o cultivo. Após um século de cruzamentos, ocorreu uma grande variação tanto no número cromossômico como na proporção desses genomas nos acessos do banco de germoplasma, no qual se espera que cerca de 80% sejam de S. officinarum e 15% de S. spontaneum e aproximadamente 5% recombinantes entres os dois genomas. No entanto, não existem informações sobre o número cromossômico e a constituição genômica dos progenitores do Banco de germoplasma envolvidos nos cruzamentos, o que eleva o número de cruzamentos inviáveis, diminuindo a eficiência na obtenção de novas variedades. Desta forma, a quantificação desses genomas é de vital importância para planejamento dos programas de melhoramento, no qual pretende estabelecer previamente as combinações parentais com maior capacidade de formar progênies promissoras, diminuindo de forma significativa os cruzamentos indesejáveis, aumentando a eficiência na obtenção de novas variedades. Atualmente, não existe um sistema prático para determinação do número crom. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Cicero Carlos de Souza Almeida - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2003 - 2006

  Mapeamento físico e análise evolutiva em Phaseolus vulgaris e Phaseolus lunatus utilizando hibridização in situ fluorescente (FISH), Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Cicero Carlos de Souza Almeida - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

Prêmios