Lucas Emanuel Silva e Oliveira

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• SILVA E OLIVEIRA, L. EMANUEL ; ALMEIDA, V.A.D. ; BORGES, N. HENRIQUE ; MARQUES, O. . 223P Agentic tumor boards: The use of large language model orchestration for therapeutic recommendations in breast cancer patients. ESMO Real World Data and Digital Oncology , v. 10, p. 100419, 2025.

• MELLO, CARLOS EDUARDO RODRIGUES ; SCHNEIDER, ELISA TERUMI RUBEL ; SILVA E OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL ; DO NASCIMENTO, JULIANA NABBOUH ; GUMIE, YOHAN BONESCKI ; DE ARAÚJO, ISABELA FONTES ; MORO, CLAUDIA . Evaluación de modelos de lenguaje en la extracción de información clínica. journal of health informatics , v. 16, p. 1, 2024.

• NIERO, LUIZ HENRIQUE PEREIRA ; SOUZA, JOÃO VITOR ANDRIOLI DE ; SILVA, LUCIANA MARTINS GOMES DA ; Gumiel, Yohan Bonescki ; BORGES, NÍCOLAS HENRIQUE ; PIOTTO, GUSTAVO HENRIQUE MUNHOZ ; GIAVARINI, GUSTAVO ; OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA E . Challenges and Issues on Extracting Named Entities from Oncology Clinical Notes. journal of health informatics , v. 15, p. 1097, 2023.

• Gumiel, Yohan Bonescki ; SILVA E OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL ; CLAVEAU, VINCENT ; GRABAR, NATALIA ; PARAISO, EMERSON CABRERA ; MORO, CLAUDIA ; Carvalho, Deborah Ribeiro . Temporal Relation Extraction in Clinical Texts. ACM COMPUTING SURVEYS , v. 54, p. 1-36, 2022.

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA E ; PETERS, ANA CAROLINA ; DA SILVA, ADALNIZA MOURA PUCCA ; GEBELUCA, CAROLINE PILATTI ; Gumiel, Yohan Bonescki ; CINTHO, LILIAN MIE MUKAI ; Carvalho, Deborah Ribeiro ; AL HASAN, SADID ; Moro, Claudia Maria Cabral . SemClinBr - a multi-institutional and multi-specialty semantically annotated corpus for Portuguese clinical NLP tasks. Journal of Biomedical Semantics , v. 13, p. 13, 2022.

• DE OLIVEIRA, LUCAS FERRO ANTUNES ; E OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA ; Gumiel, Yohan Bonescki ; Carvalho, Deborah Ribeiro ; Moro, Claudia Maria Cabral . Defining a state-of-the-art POS-tagging environment for Brazilian Portuguese clinical texts. RESEARCH ON BIOMEDICAL ENGINEERING , v. 36, p. 1-10, 2020.

• DALLOUX, CLÉMENT ; CLAVEAU, VINCENT ; GRABAR, NATALIA ; OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA ; Moro, Claudia Maria Cabral ; Gumiel, Yohan Bonescki ; Carvalho, Deborah Ribeiro . Supervised learning for the detection of negation and of its scope in French and Brazilian Portuguese biomedical corpora. Natural Language Engineering , v. X, p. 1-21, 2020.

• GUMIEL, Y. B. ; OLIVEIRA, L. E. S. ; MONTENEGRO, C. O. ; BANTLE, C. D. ; MAGRO, L. S. D. ; FADEL, E. M. ; GEBELUCA, C. P. ; CINTHO, L. M. M. ; MORO, C. ; CARVALHO, D. R. . A PRE-ANNOTATION TOOL FOR EVENT EXTRACTION IN CARDIOLOGY AMBULATORY TEXTS IN BRAZILIAN PORTUGUESE. IBEROAMERICAN JOURNAL OF APPLIED COMPUTING , v. 10, p. 1-7, 2020.

• GOMES, DENILSEN CARVALHO ; OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA E ; CUBAS, MARCIA REGINA ; BARRA, CLAUDIA MARIA CABRAL MORO . USE OF COMPUTATIONAL TOOLS AS SUPPORT TO THE CROSS-MAPPING METHOD BETWEEN CLINICAL TERMINOLOGIES. TEXTO & CONTEXTO ENFERMAGEM , v. 28, p. 1-12, 2019.

• BORIM, H. C. ; MUKAI, L. M. ; OLIVEIRA, L. E. S. ; LOPES, V. J. ; MORO, C. M. C. . Integrating Methods to Evaluate Health Information Systems. Studies in Health Technology and Informatics , v. 40603, p. 100-104, 2015.

• Martins, Anderson Carlos Gomes ; Rodrigues de Freitas, Andrey ; Sawazaki, Caroline Midori Rozza ; SILVA E OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL ; Vidal, Caroline ; de Souza Pinto, João Gabriel . Developing Resource-Efficient Clinical LLMs for Brazilian Portuguese. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer Nature Switzerland, 2025, v. 15415, p. 46-60.

• Prado, Carolina Braun ; Gumiel, Yohan Bonescki ; SCHNEIDER, ELISA TERUMI RUBEL ; CINTHO, LILIAN MIE MUKAI ; de Souza, João Vitor Andrioli ; OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA E ; PARAISO, EMERSON CABRERA ; Rebelo, Marina Sa ; Gutierrez, Marco Antonio ; Pires, Fabio Antero ; Krieger, José Eduardo ; MORO, CLAUDIA . De-Identification Challenges in Real-World Portuguese Clinical Texts. IFMBE Proceedings. 1ed.: Springer Nature Switzerland, 2024, v. , p. 584-590.

• OLIVEIRA, L. F. A. ; PAGANO, A. ; OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA ; MORO, C. M. C. . Challenges in Annotating a Treebank of Clinical Narratives in Brazilian Portuguese. Computational Processing of the Portuguese Language. PROPOR 2022.. 132ed.: , 2022, v. , p. 90-100.

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA ; SCHNEIDER, E. T. R. ; Gumiel, Yohan Bonescki ; LUZ, M. A. P. ; PARAISO, E. C. ; BARRA, CLAUDIA MARIA CABRAL MORO . Experiments on Portuguese Clinical Question Answering. In: Britto A., Valdivia Delgado K.. (Org.). Experiments on Portuguese Clinical Question Answering. 130ed.: , 2021, v. 13074, p. 133-145.

• de Souza, João Vitor Andrioli ; OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA E ; Gumiel, Yohan Bonescki ; Carvalho, Deborah Ribeiro ; Moro, Claudia Maria Cabral . Exploiting Siamese Neural Networks on Short Text Similarity Tasks for Multiple Domains and Languages. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer International Publishing, 2020, v. , p. 357-367.

• NIERO, LUIZ HENRIQUE PEREIRA ; GUILHERME, IVAN RIZZO ; OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA E ; DE ARAÚJO FILHO, GERARDO MARIA . PsyBERTpt: A Clinical Entity Recognition Model for Psychiatric Narratives. In: 2023 IEEE 36th International Symposium on ComputerBased Medical Systems (CBMS), 2023, L'Aquila. 2023 IEEE 36th International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS), 2023. p. 672.

• PAGANO, ADRIANA S. ; CONEGLIAN, ANDRÉ V. LOPES ; SILVA E OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL . A dependency-based study of medicine package inserts in Brazilian Portuguese. In: Simpósio Brasileiro de Tecnologia da Informação e da Linguagem Humana, 2023, Brasil. Anais do XIV Simpósio Brasileiro de Tecnologia da Informação e da Linguagem Humana (STIL 2023). p. 463.

• PAVANELLI, L. ; SCHNEIDER, E. T. R. ; GUMIEL, Y. B. ; FERREIRA, T. C. ; OLIVEIRA, L. F. A. ; SOUZA, J. V. A. ; PAIVA, G. P. M. ; OLIVEIRA, L. E. S. ; MORO, CLAUDIA M. C. ; PARAISO, E. C. ; PAGANO, A. . PUCRJ-PUCPR-UFMG at eHealth-KD Challenge 2021: A Multilingual BERT-based System for Joint Entity Recognition and Relation Extraction. In: Iberian Languages Evaluation Forum (IberLEF 2021) co-located with the Conference of the Spanish Society for Natural Language Processing (SEPLN 2021), 2021, Málaga, Espanha. Proceedings of the Iberian Languages Evaluation Forum (IberLEF 2021) co-located with the Conference of the Spanish Society for Natural Language Processing (SEPLN 2021), 2021.

• SOUZA, J. V. A. ; OLIVEIRA, LUCAS E. S. ; GUMIEL, Y. B. ; CARVALHO, D. R. ; BARRA, C. M. C. M. . Incorporating multiple feature groups to a Siamese Neural Network for Semantic Textual Similarity task in Portuguese texts. In: ASSIN 2 Shared Task: Evaluating Semantic Textual Similarity and Textual Entailment in Portuguese, 2020. Proceedings of the ASSIN 2 Shared Task: Evaluating Semantic Textual Similarity and Textual Entailment in Portuguese, 2020.

• SCHNEIDER, E. T. R. ; SOUZA, J. V. A. ; KNAFOU, J. ; OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA E ; COPARA, J. ; GUMIEL, Y. B. ; OLIVEIRA, L. F. A. ; PARAISO, E. C. ; TEODORO, D. ; BARRA, C. M. C. M. . BioBERTpt - A Portuguese Neural Language Model for Clinical Named Entity Recognition. In: Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing, 2020, Online. Proceedings of the 3rd Clinical Natural Language Processing Workshop, 2020. p. 65-72.

• de Souza, João Vitor Andrioli ; SCHNEIDER, E. T. R. ; CEZAR, J. O. ; OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA ; GUMIEL, Y. B. ; PARAISO, E. C. ; TEODORO, D. ; MORO, C. M. C. . A Multilabel Approach to Portuguese Clinical Named Entity Recognition. In: CBIS 2020 - XVII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2020, Foz do Iguaçu. CBIS 2020 - XVII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2020.

• PAIVA, G. P. M. ; SCHNEIDER, E. T. R. ; CEZAR, J. O. ; OLIVEIRA, L. F. A. ; de Souza, João Vitor Andrioli ; GUMIEL, Y. B. ; OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA ; PARAISO, E. C. ; MORO, C. M. C. . COVID 19: O que sentem os brasileiros de acordo com o Twitter?. In: CBIS 2020 - XVII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2020, Foz do Iguaçu. CBIS 2020 - XVII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2020.

• SOUZA, J. V. A. ; GUMIEL, Y. B. ; OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA E ; MORO, C. M. C. . Named Entity Recognition for Clinical Portuguese Corpus with Conditional Random Fields and Semantic Groups. In: XIX SIMPÓSIO BRASILEIRO DE COMPUTAÇÃO APLICADA À SAÚDE, 2019, Niterói. 2019: Anais do XIX Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde, 2019.

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA E ; GUMIEL, Y. B. ; SANTOS, A. B. V. ; CINTHO, L. M. M. ; CARVALHO, D. R. ; HASAN, S. A. ; MORO, C. M. C. . Learning Portuguese Clinical Word Embeddings: A Multi-Specialty and Multi-Institutional Corpus of Clinical Narratives Supporting a Downstream Biomedical Task. In: MEDINFO 2019 - 17th World Congress of Medical and Health Informatics, 2019, Lyon. MEDINFO 2019: Health and Wellbeing e-Networks for All, 2019. v. 264.

• CLAVEAU, V. ; OLIVEIRA, L. E. S. ; BOUZILLE, G. ; CUGGIA, M. ; MORO, C. M. C. ; GRABAR, N. . Numerical Eligibility Criteria in Clinical Protocols: Annotation, Automatic Detection and Interpretation. In: Artificial Intelligence in Medicine, 2017, Viena. 16th Conference on Artificial Intelligence in Medicine, AIME 2017 - Vienna, Austria, June 21?24, 2017 - Proceedings, 2017.

• OLIVEIRA, LUCAS E. S. ; GEBELUCA, CAROLINE P. ; SILVA, ADALNIZA M. P. ; MORO, CLAUDIA M. C. ; HASAN, SADID A. ; FARRI, OLADIMEJI . A statistics and UMLS-based tool for assisted semantic annotation of Brazilian clinical documents. In: 2017 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), 2017, Kansas City. 2017 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), 2017. p. 1072.

• OLIVEIRA, L. E. S. ; HASAN, S. A. ; FARRI, O. ; BARRA, C. M. C. M. . TRANSLATION OF UMLS ONTOLOGIES FROM EUROPEAN PORTUGUESE TO BRAZILIAN PORTUGUESE. In: CBIS 2016 - XV Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2016, Goiânia. CBIS 2016 - XV Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2016.

• ANDRADE, G. H. B. ; OLIVEIRA, L. E. S. ; MORO, C. M. C. . METODOLOGIAS E FERRAMENTAS PARA ANOTAÇÃO DE NARRATIVAS CLÍNICAS. In: CBIS 2016 - XV Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2016, Goiânia. CBIS 2016 - XV Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2016.

• OLIVEIRA, L. E. S. ; SOUZA, A. C. ; NOHAMA, P. ; BARRA, C. M. C. M. . A Novel Method for Identifying Continuity of Care in Hospital Discharge Summaries. In: The International Conference on Health Informatics, 2013, Vila Moura. IFMBE Proceedings, 2013. v. 42. p. 284-287.

• OLIVEIRA, L. E. S. ; BARRA, C. M. C. M. ; SOUZA, A. C. ; NOHAMA, P. ; CANCIAN, P. S. . IDENTIFICAÇÃO DE CONTINUIDADE DE CUIDADO EM SUMÁRIOS DE ALTA HOSPITALAR. In: XIII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2012, Curitiba. Anais do XIII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2012.

• BORGES, N. H. ; SILVA E OLIVEIRA, L. EMANUEL ; CAZAGRANDA, I. ; ALBUQUERQUE, C. B. ; MARQUES, O. ; COSTA, C. N. . Simulating Personalized Patient Journeys for Early Cancer Detection Using Artificial Intelligence Synthetic Data. In: San Antonio Breast Cancer, 2025, San Antonio/TX. San Antonio Breast Cancer 2025, 2025.

• OLIVEIRA, LUCAS E. S. ; NIERO, L. H. P. ; SOUZA, J. V. A. ; BORGES, N. H. ; ZIMMERMANN, L. ; GIAVARINI, G. C. ; SILVA NETO, J. M. ; DIAS, J. M. ; RIBEIRO, D. M. ; PRETO, D. D. . Técnicas de Processamento de Linguagem Natural como ferramenta para aprimorar o recrutamento de pacientes oncológicos em ensaios clínicos. In: Next Frontiers to Cure Cancer 2022, 2022. Next Frontiers to Cure Cancer 2022, 2022.

• SILVA E OLIVEIRA, L. EMANUEL ; BORGES, N. H. ; MARQUES, O. . AI in Cancer Care: A Systematic Review of Large Language Models in Tumor Board Practice. In: XXVII Congresso da Sociedade Brasileira de Oncologia Clínica, 2025, Rio de Janeiro. XXVII Congresso da Sociedade Brasileira de Oncologia Clínica, 2025.

• BORGES, N. H. ; MARQUES, O. ; SILVA E OLIVEIRA, L. EMANUEL . Artificial Intelligence in Oncology Trials: A Global Systematic Review of Clinical Trial Registries. In: XXVII Congresso da Sociedade Brasileira de Oncologia Clínica, 2025, Rio de Janeiro. XXVII Congresso da Sociedade Brasileira de Oncologia Clínica, 2025.

• SCHNEIDER, ELISA TERUMI RUBEL ; Gumiel, Yohan Bonescki ; de Souza, João Vitor Andrioli ; MIE MUKAI, LILIAN ; EMANUEL SILVA E OLIVEIRA, LUCAS ; DE SA REBELO, MARINA ; ANTONIO GUTIERREZ, MARCO ; EDUARDO KRIEGER, JOSE ; TEODORO, DOUGLAS ; MORO, CLAUDIA ; PARAISO, EMERSON CABRERA . CardioBERTpt: Transformer-based Models for Cardiology Language Representation in Portuguese. In: 2023 IEEE 36th International Symposium on ComputerBased Medical Systems (CBMS), 2023, L'Aquila. 2023 IEEE 36th International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS), 2023. p. 378.

• RONNAU, L. B. ; TORRES, F. B. G. ; OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA E ; GOMES, DENILSEN CARVALHO ; CUBAS, MARCIA REGINA ; MORO, C. M. C. . Automatic Mapping Between Brazilian Portuguese Clinical Terms and International Classification for Nursing Practice. In: MEDINFO 2019 - 17th World Congress of Medical and Health Informatics, 2019, Lyon. MEDINFO 2019 - 17th World Congress of Medical and Health Informatics, 2019.

• HASAN, S. A. ; ZHU, X. ; LIU, J. ; MORO, C. M. C. ; OLIVEIRA, L. E. S. ; FARRI, O. . Ontology-Driven Semantic Search for Brazilian Portuguese Clinical Notes. In: MEDINFO 2015 - 15th World Congress on Health and Biomedical Informatics, 2015, São Paulo. Studies in Health Technology and Informatics. Amsterdã: IOS PRESS, 2015. v. 216.

• OLIVEIRA, L. E. S. ; SOUZA, A. C. ; NOHAMA, P. ; BARRA, C. M. C. M. . A rule-based method for continuity of care identification in discharge summaries. In: 14th International Congress on Medical Informatics, 2013, Copenhagen. 14th International Congress on Medical Informatics, 2013.

• SILVA E OLIVEIRA, L. EMANUEL ; ALMEIDA, V. A. ; BORGES, N. H. ; MARQUES, O. . Agentic tumor boards: The use of large language model orchestration for therapeutic recommendations in breast cancer patients. 2025. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• SILVA E OLIVEIRA, L. EMANUEL . Workshop de IA para médicos. 2025. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA . IA para Inovação Médica. 2024. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA . IA nos Negócios e IA Generativa. 2024. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA . IA na Pesquisa Clínica. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA . Estruturando os dados do Prontuário Eletrônico. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA . IA em Saúde. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA . Machine Learning para Product Managers - Utilizando IA para construção de um produto em Saúde. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA . Health AI & Generative Models. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA . Health Natural Language Processing: Uma breve introdução. 2021. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA . Processamento de Linguagem Natural em Saúde. 2021. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA . Tutorial - NLP: conceitos, implementação e aplicações. 2020. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• SOUZA, J. V. A. ; OLIVEIRA, L. E. S. ; GUMIEL, Y. B. ; MORO, C. M. C. . Named Entity Recognition for Clinical Portuguese Corpus with Conditional Random Fields and Semantic Groups. 2019. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• OLIVEIRA, L. E. S. ; SANTOS, A. B. V. ; GUMIEL, Y. B. ; CARVALHO, D. R. ; MORO, C. M. C. ; HASAN, S. A. . Learning Portuguese Clinical Word Embeddings: A Multi-Specialty and Multi-Institutional Corpus of Clinical Narratives Supporting a Downstream Biomedical Task. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA E . Sumarização de dados longitudinais de pacientes com Doença Renal Crônica. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• OLIVEIRA, LUCAS EMANUEL SILVA E . SUMARIZAÇÃO DE DADOS LONGITUDINAIS DE PACIENTES COM DOENÇA RENAL CRÔNICA. 2019. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• OLIVEIRA, L. E. S. ; GEBELUCA, CAROLINE P. ; SILVA, ADALNIZA M. P. ; MORO, C. M. C. ; HASAN, S. A. ; FARRI, O. . A statistics and UMLS-based tool for assisted semantic annotation of Brazilian clinical documents. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• OLIVEIRA, L. E. S. ; HASAN, S. A. ; FARRI, O. ; MORO, C. M. C. . TRANSLATION OF UMLS ONTOLOGIES FROM EUROPEAN PORTUGUESE TO BRAZILIAN PORTUGUESE. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• OLIVEIRA, L. E. S. . Processamento de Linguagem Natural e suas aplicações. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• OLIVEIRA, L. E. S. ; MORO, C. M. C. ; SOUZA, A. C. ; NOHAMA, P. ; CANCIAN, P. S. . IDENTIFICAÇÃO DE CONTINUIDADE DE CUIDADO EM SUMÁRIOS DE ALTA HOSPITALAR. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2023 - Atual

  MED-LLM-BR, Descrição: A project between which aims to develop multiple medical LLMs for pt-BR, including base models and task-specific models, with different sizes (7B and 70B parameters).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador / João Gabriel de Souza Pinto - Integrante / Andrey Rodrigues de Freitas - Integrante / Anderson Carlos Gomes Martins - Integrante / Caroline Midori Rozza Sawazaki - Integrante / Caroline Vidal - Integrante.

• 2021 - 2024

  Aprendizado de Máquina em Medicina Cardiovascular - Parte Processamento de Linguagem Natural, Descrição: O objetivo do estudo é utilizar a inteligência artificial para melhorar a previsão de risco de doenças cardiovasculares, utilizando análise de imagens médicas, detecção de sinais biomédicos, processamento de linguagem natural de narrativas médicas e integração com informações sobre o genoma de participantes.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Integrante / Claudia Maria Cabral Moro Barra - Integrante / Gumiel, Yohan Bonescki - Integrante / Gutierrez, Marco Antonio - Coordenador.

• 2020 - 2023

  AI for Oncology, Descrição: Desenvolvimento de modelos de extração de informação e interpretação de dados clínicos de pacientes oncológicos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador / NIERO, LUIZ HENRIQUE PEREIRA - Integrante / GUILHERME, IVAN RIZZO - Integrante.

• 2020 - 2022

  Exploring deep language models to leverage Portuguese and French biomedical semantic resources, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Claudia Maria Cabral Moro Barra em 09/04/2021., Descrição: High quality and comprehensive data are paramount for advances in life sciences research andinnovations. However, due to the heterogeneity of biomedical data sources, raw data cannot often beseamlessly integrated and interoperated. Standard terminologies and ontologies, such as ICD,SNOMED-CT and Gene Ontology, have been thus proposed as higher abstraction levels to bringsemantic interoperability to these sources. While there is a large body of such semantic resources inEnglish, other languages, including French, German and Portuguese, are much less represented.Recently, text mining methods supported by deep language models, such as ELMo and BERT, haveachieved outstanding performances for normalising and mapping raw biomedical data into standardontologies. These methods profit greatly from publicly available language models trained on specificbiomedical corpora. The current lack of semantic resources and language models in non-Englishlanguages jeopardise the effective utilisation of biomedical data in many language communities. In thiscollaboration project, we will profit from the complementary text mining expertise between the projectmembers to train and release deep language models trained French and Portuguese biomedical corporamanaged by the partners. We will leverage and extend a clinical Portuguese corpus annotated withSNOMED-CT concepts and train a deep language model on it. The same process will be applied to acohort data encoded in French. We will then evaluate the effectiveness of these models to extractinformation from unstructured sources in both languages. The deep language models resulted from theproject will be publicly released to foster text mining research in French and Portuguese. The extendedcorpora and the models created will serve as basis for future research and collaboration between thegroup members.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Integrante / Claudia Maria Cabral Moro Barra - Coordenador / João Vitor Andrioli de Souza - Integrante / Elisa Terumi Rubel Schneider - Integrante / Julien Knafou - Integrante / Jenny Copara - Integrante / Lucas Ferro Antunes de Oliveira - Integrante / Douglas Teodoro - Integrante., Financiador(es): Centro Latinoamerciano-Suizo de la Universidad de San Galen - Cooperação.

• 2016 - 2020

  FIGTEM: FineGrained Text Mining for Clinical Trials, Descrição: To develop Natural Language Processing methods (eg, information extraction and indexing) dedicated toclinical trials and in the scope of different languages in order to populate formal representation of patients and clinicaltrials. These methods will be used within a recruitment support system for the purpose of the clinical and therapeutic trials.Hence, we propose to develop text representation relying on finegrained semantic annotation and spectral analysis, and then to map these representations to eligibility criteria for the trials with semisupervised machine learning approaches.The evaluation of these methods will be performed in a cross border recruitment scenario.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Integrante / Claudia Maria Cabral Moro Barra - Integrante / Vincent Claveau - Coordenador / Marc Cuggia - Integrante / Natalia Grabar - Integrante.

• 2015 - 2020

  NLP for Portuguese Clinical Documents, Projeto certificado pela empresa PHILIPS MEDICAL SYSTEMS LTDA em 20/06/2016., Descrição: Development of algorithms using Natural Language Processing for Semantic Search and Summarization on Brazilian Portuguese Clinical Narratives.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Integrante / Claudia Maria Cabral Moro Barra - Coordenador / Sadid Hasan - Integrante / Oladimeji Farri - Integrante., Financiador(es): Philips Medical Systems - Bolsa.

• 2011 - 2014

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Claudia Maria Cabral Moro Barra em 14/06/2024., Descrição: Edital n 09/2010 - PDI - Pequeno Porte Edital MCT/CNPq n 09/2010 PDI - Tecnologia da Informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Integrante / Claudia Maria Cabral Moro Barra - Coordenador / Percy Nohama - Integrante.

Projetos de desenvolvimento

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2021 - Atual

  Inteligência Artificial no recrutamento de pacientes para Ensaios Clínicos, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2021 - Atual

  Inteligência Artificial no recrutamento de pacientes para Ensaios Clínicos, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador.

• 2011 - 2013

  Recuperação Semântica de Informações em Bases Multilíngüe Visando o Apoio à Decisão na Área de Saúde, Descrição: Desenvolvimento de metodologias para a recuperação semântica de informações em bases multilíngüe visando o suporte à decisão na área de saúde.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2023 - Atual

  com+agents, Descrição: Generative AI to create Agents to interpret and extract information from medical notes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador / SOUZA, JOÃO VITOR ANDRIOLI DE - Integrante / João Gabriel de Souza Pinto - Integrante.

• 2023 - Atual

  CancerCare Navigator, Descrição: A dialog system to guide patients through the complex landscape of oncology, offering personalized recommendations and support for the journey ahead.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador / Vanessa Miranda - Integrante.

• 2022 - Atual

  com+data, Descrição: A NLP pipeline to structure and organize medical data. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador / SOUZA, JOÃO VITOR ANDRIOLI DE - Integrante.

• 2020 - Atual

  com+trials, Descrição: Building an AI-based clinical trials recruitment system. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador / NIERO, LUIZ HENRIQUE PEREIRA - Integrante / SOUZA, JOÃO VITOR ANDRIOLI DE - Integrante.

• 2023 - Atual

  com+agents, Descrição: Generative AI to create Agents to interpret and extract information from medical notes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador / SOUZA, JOÃO VITOR ANDRIOLI DE - Integrante / João Gabriel de Souza Pinto - Integrante.

• 2023 - Atual

  CancerCare Navigator, Descrição: A dialog system to guide patients through the complex landscape of oncology, offering personalized recommendations and support for the journey ahead.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador / Vanessa Miranda - Integrante.

• 2022 - Atual

  com+data, Descrição: A NLP pipeline to structure and organize medical data. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador / SOUZA, JOÃO VITOR ANDRIOLI DE - Integrante.

• 2020 - Atual

  com+trials, Descrição: Building an AI-based clinical trials recruitment system. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Lucas Emanuel Silva e Oliveira - Coordenador / NIERO, LUIZ HENRIQUE PEREIRA - Integrante / SOUZA, JOÃO VITOR ANDRIOLI DE - Integrante.

Prêmios