Carla Martins Lopes
Possui graduação (2005) em Ciências Biológicas (licenciatura e bacharelado), pela Universidade Estadual de Londrina, mestrado (2007) e doutorado (2011) em Genética e Biologia Molecular, pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Foi bolsista de pós-doutorado CNPq, na Université Grenoble Alpes - França (2012 - 2013), e bolsista de pós-doutorado CNPq e FAPESP (2014 - 2022), na Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (UNESP). Foi bolsista DTI-A CNPq (2022-1024), no Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Sistemas Autônomos Cooperativos Aplicados em Segurança e Meio Ambiente, na Universidade de São Paulo (USP). É coordenadora do grupo de DNA dentro do Brazilian Team, terceiro colocado na competição internacional XPrize Rainforest. Atualmente é bolsista SET-A na empresa GenomaA. Tem experiência na área de ecologia molecular, e no desenvolvimento e aplicação de abordagens envolvendo DNA ambiental para estudar ecologia de comunidades, e os efeitos dos impactos antrópicos para conservação da biodiversidade tropical.
Informações coletadas do Lattes em 01/11/2025
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Genética e Biologia Molecular
2007 - 2011
Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Título: História evolutiva de Ctenomys minutus e Ctenomys lami (Rodentia, Ctenomyidae) na planície costeira do Sul do Brasil
Thales Renato Ochotorena de Freitas. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Mestrado em Genética e Biologia Molecular
2006 - 2007
Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Título: Filogeografia de Ctenomys minutus (Rodentia: Ctenomyidae), Ano de Obtenção: 2007
Thales Renato Ochotorena de Freitas.Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Graduação em Ciências Biológicas - Bacharelado
2001 - 2005
Universidade Estadual de Londrina
Título: Análise da estrutura genética de Salminus brasiliensis (Pisces, Characiformes) no Complexo Canoas - rio Paranapanema, como ferramenta na avaliação das escadas de transposição de peixes.
Orientador: Leda Maria Koelblinger Sodré
Bolsista do(a): Duke Energy Geração Paranapanema, DUKE, Brasil.
Graduação em Ciências Biológicas - Licenciatura
2001 - 2004
Universidade Estadual de Londrina
Orientador: Leda Maria K. Sodre
Bolsista do(a): Duke Energy Geração Paranapanema, DUKE, Brasil.
Pós-doutorado
2021 - 2022
Pós-Doutorado. , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
2016 - 2021
Pós-Doutorado. , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
2014 - 2016
Pós-Doutorado. , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
2012 - 2013
Pós-Doutorado. , Université Joseph Fourier - Grenoble I, UJF, França. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Formação complementar
2019 - 2019
Biosecurity Awareness. , Macquarie University, MACQUARIE, Austrália.
2019 - 2019
Analysis of metagenetic data for macroecology. (Carga horária: 48h). , University of Cyprus, UC, Chipre.
2019 - 2019
Approved Arrangements for Accredited Persons. , Macquarie University, MACQUARIE, Austrália.
2017 - 2017
7th Metabarcoding Spring School. (Carga horária: 70h). , Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, CIBIO, Portugal.
2013 - 2013
Programming for Evolutionary Biology. (Carga horária: 160h). , Universidade de Leipzig, UL, Alemanha.
2013 - 2013
Introdução ao software R. (Carga horária: 14h). , Centre National de la Recherche Scientifique, CNRS, França.
2008 - 2008
Uso de modelos de nicho ecológico como suporte de. (Carga horária: 35h). , Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
2007 - 2007
Curso teórico-prático de filogenia molecular. (Carga horária: 15h). , Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
2005 - 2005
Genética de Microorganismos e suas Aplicações. (Carga horária: 24h). , Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.
2004 - 2004
Biotecnologia e Biossegurança. (Carga horária: 36h). , Instituto de Tecnologia e Desenvolvimento Econômico e Social, ITEDES, Brasil.
2004 - 2004
Transplantes: Tipagem HLA por Biologia Molecular. (Carga horária: 20h). , Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.
2003 - 2003
Biologia Molecular e Bioinformática - Módulo I. (Carga horária: 9h). , Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.
2003 - 2003
Novas Fronteiras da Genética Humana. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.
2002 - 2002
Microorganismos em Engenharia Genética. (Carga horária: 9h). , Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.
2001 - 2001
Bilogia Molecular Aplicada à Saúde. (Carga horária: 3h). , Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Francês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Ecologia Molecular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética da Conservação.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: DNA ambiental.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Evolução.
Organização de eventos
MORELLATO, L. P. C. ; FERRO, M. ; LOPES, C. M. ; HADDAD, C. F. B. ; SILVA, S. R. ; MIRANDA, V. F. O. ; SILVA, C. P. ; LEAL, B. S. S. ; CHAVES, C. J. N. . 1°Workshop CBioClima. 2023. (Outro).
LOPES, C. M. . IV Ciclo de palestras - Mamíferos do Rio Grande do Sul. 2009. (Outro).
LOPES, C. M. . III Ciclo de Palestras - Mamíferos do Rio Grande do Sul. 2008. (Outro).
LOPES, C. M. . I Congresso Sul-Americano de Mastozoologia. 2006. (Congresso).
LOPES, C. M. . XXVI Congresso Brasileiro de Zoologia. 2006. (Congresso).
LOPES, C. M. . I Ciclo de Palestras - Mamíferos do Rio Grande do Sul. 2006. (Outro).
Participação em eventos
61ˢᵗ Annual Meeting of the Association for Tropical Biology and Conservation. Speeding up biodiversity assessment in tropical forests using (e/i)DNA (meta)barcoding approaches. 2025. (Congresso).
9th International Barcode of Life Conference. Biodiversity assessment using cutting-edge technologies: where robotics meets molecular biology. 2024. (Congresso).
Conservation Genomics Paris.eDNA reveals disappeared amphibians and fungal pathogen co-occurences in a biodiversity hotspot. 2024. (Oficina).
São Paulo Climate Week.Rainforest XPrize | ALANA - novas tecnologias e soluções escalonáveis para a biodiversidade. 2024. (Outra).
VII Simpósio de Zoologia Sistemática.Filogenômica. 2024. (Simpósio).
1° Workshop CBioClima.1°Workshop CBioClima. 2023. (Outra).
73 Congresso Nacional de Botânica. Uso de DNA barcoding e metabarcoding (eDNA/iDNA) no reconhecimento das espécies. 2023. (Congresso).
58th Annual Meeting of the Association for Tropical Biology and Conservation. Emerging approaches for biodiversity monitoring in tropical environments. 2022. (Congresso).
67th Brazilian Congress of Genetics. What are the challenges we face to adopt eDNA as a mainstream approach for biodiversity monitoring?. 2022. (Congresso).
Plano Estratégico de Conservação de Anfíbios (PECAn). 2022. (Outra).
9th World Congress of Herpetology. Latest news of environmental DNA metabarcoding approach for monitoring amphibian species in tropical forests. 2020. (Congresso).
XI Congreso Latinoamericano de Herpetología. The potential of eDNA metabarcoding for detecting locally extinct, missing, or declined amphibian species in tropical forests. 2017. (Congresso).
Annual Meeting of the Association for Tropical Biology and Conservation. eDNA metabarcoding versus traditional methods for anuran surveys in the highly biodiverse Brazilian Atlantic Forest. 2016. (Congresso).
Congress of the European Society of the Evolutionary Biology. Secondary contact, reproductive barriers, and introgression: habitat alterations influencing the evolutionary history of two subterranean rodent species (Rodentia: Ctenomyidae). 2015. (Congresso).
Ecology and Evolutionary Biology Symposium.Resource availability versus resource use: diet assessment of subterranean rodents using DNA metabarcoding. 2015. (Simpósio).
60° Congresso Brasileiro de Genética. DNA metabarcoding diet analysis for species with parapatric versus sympatric distribution: a case study on subterranean rodents. 2014. (Congresso).
7º Congresso brasileiro de mastozoologia. Genética e conservação de roedores. 2014. (Congresso).
7º Congresso brasileiro de mastozoologia. DNA metabarcoding diet analysis for species with parapatric versus sympatric distribution: a case study on subterranean rodents. 2014. (Congresso).
DNA Watch. Using environmental and degraded DNA analysis to understand biodiversity, food webs and ecosystem functioning.DNA metabarcoding diet analysis in parapatric versus sympatric species distribution: a case study on subterranean rodents. 2013. (Outra).
56° Congresso Brasileiro de Genética. Evolução em tempo real: o exemplo dos Ctenomídeos na planície costeira do sul do Brasil. 2010. (Congresso).
UNITIG 2010 - Novas tecnologias em análise e sequenciamento de ácidos nucléicos. 2010. (Outra).
2nd Biological Evolution Workshop. 2009. (Outra).
IMC10 International Mammalogical Congress. Phylogeography of Ctenomys lami (Rodentia, Ctenomyidae). 2009. (Congresso).
IV Ciclo de palestras - Mamíferos do Rio Grande do Sul. 2009. (Outra).
IV Congresso Brasileiro de Mastozoologia. Polimorfismos cromossômicos e barreiras geográficas: influências na organização da variabilidade genética em Ctenomys minutus (Rodentia, Ctenomyidae).. 2008. (Congresso).
IV Simpósio de áreas protegidas.Abordagens multidisciplinares em conservação. 2008. (Simpósio).
53° Congresso Brasileiro de Genética. Filogeografia de Ctenomys minutus (Rodentia: Ctenomyidae): dados preliminares.. 2007. (Congresso).
First Biological Evolution Workshop. 2007. (Outra).
52° Congresso brasileiro de genética. Análise da estrutura genética de Salminus brasiliensis (Pisces, Characiformes) no complexo Canoas - rio Paranapanema, como ferramenta de avaliação da eficiência das escadas de transposição de peixes.. 2006. (Congresso).
I Ciclo de Palestras Mamíferos RS. 2006. (Outra).
I Congresso Sul-Americano de Mastozoologia. Estudos filogeográficos preliminares de Ctenomys minutus (Rodentia: Ctenomyidae) através da análise de uma seqüência da região controladora do DNAmt. 2006. (Congresso).
XXVI Congresso Brasileiro de Zoologia. Análise da estrutura genética de Salminus brasiliensis na UHE de Canoas I - rio Paranapanema.. 2006. (Congresso).
51° Congresso Brasileiro de Genética. Estrutura Genética de Iheringichthys labrosus (Pisces, Pimelodidae) do Reservatório Capivara - Rio Paranapanema.. 2005. (Congresso).
XI Seminário de apresentação das monografias do curso de bacharelado em Ciências Biológicas.Análise da estrutura genética de Salminus brasiliensis (Pisces, Characiformes) no complexo Canoas - rio Paranapanema, como ferramenta de avaliação das escadas de transposição de peixes.. 2005. (Seminário).
50° Congresso Brasileiro de Genética. Análise Genética de Iheringichthys labrosus (Pisces, Pimelodidae) do Reservatório Capivara - Rio Paranapanema.. 2004. (Congresso).
I Simpósio Paranaense de Patologia Experimental. 2004. (Simpósio).
IX Seminário de Apresentação das Monografias do Curso de Bacharelado em Ciências Biológicas. 2004. (Seminário).
VI Congresso Londrinense de Biologia Aplicada à Saúde. 2004. (Congresso).
VII Encontro Paranaense de Genética. 2004. (Encontro).
X Seminário de Apresentação das Monografias do Curso de Bacharelado em ciências Biológicas. 2004. (Seminário).
49° Congresso Nacional de Genética. 2003. (Congresso).
I Ciclo de Palestras do Curso de Biologia. 2003. (Outra).
IV Mostra de Painéis de Imunologia do Curso de Ciências Biológicas. 2003. (Outra).
VIII Seminário de Apresentação das Monografias do Curso de Bacharelado em Ciências Biológicas. 2003. (Seminário).
VI Encontro Paranaense de Genética. 2002. (Encontro).
I Encontro Paranaense de Biomedicina. 2001. (Encontro).
IV Congresso Londrinense de Biologia Aplicada à Saúde. 2001. (Congresso).
Participação em bancas
LOPES, C. M.; GRANT, T.; TWOMEY, E.; VASCONCELLOS, M.. Polimorfismo de cor no gênero Brachycephalus (Anura: Brachycephalidae): abordagens genéticas e evolução. 2024. Tese (Doutorado em Ciencias Biologicas (Zoologia)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
LOPES, C. M.; CARVALHO, F. A.; CARVALHO, D. C.; NOBILE, A. B.; READY, J. S.; SALES, N. G.. DNA ambiental metabarcoding aplicado ao manejo e conservação de peixes. 2023. Tese (Doutorado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.
LOPES, C. M.; FAGUNDES, N. J. R.. Métodos genéticos de Barcoding e Metabarcoding como ferramentas para conservação de elasmobrânquios (Pisces: Chondrichthyes).. 2022. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.
LOPES, C. M.; MALTEMPI, P. P. P.;HADDAD, C. F. B.. Color polymorphism in the genus Brachycephalus (Anura: Brachycephalidae): genetic approaches and evolution. 2023. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencias Biologicas (Zoologia)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
LOPES, C. M.; FUSINATTO, L.. Variação genética e morfológica das espécies de Thoropa Cope, 1865 (Anura: Cycloramphidae). 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencias Biologicas (Zoologia)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
LOPES, CM.. XXVIII Congresso de Iniciação Científica UNESP. 2016. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
LOPES, C. M.. Aykut Kence Student Prize at the 2nd Ecology and Evolution Symposium. 2015. Middle East Technical University.
LOPES, C. M.. XXVII Congresso de Iniciação Científica. 2015. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Orientou
Padrões espaciais e temporais de ocorrência de anuros em riachos de Mata Atlântica e sua detecção por meio de DNA ambiental; 2016; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Ecologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Carla Martins Lopes;
O uso do íntron trnL (UAA) como ferramenta para a análise da dieta de duas espécies do gênero Ctenomys (Rodentia, Ctenomyidae) no Rio Grande do Sul, Brasil; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Martins Lopes;
Análises citogenéticas de uma zona híbrida interespecífica em Ctenomys minutus e Ctenomys lami (Rodentia: Ctenomyidae); 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Martins Lopes;
O uso do íntron trnL (UAA) como ferramenta para a análise da dieta de duas espécies do gênero Ctenomys (Rodentia, Ctenomyidae) no Rio Grande do Sul, Brasil; ; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Martins Lopes;
Análises citogenéticas de uma zona híbrida interespecífica em Ctenomys minutus e Ctenomys lami (Rodentia: Ctenomyidae); 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Martins Lopes;
Produções bibliográficas
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LOPES, C. M. ; BECKER, C. G. ; Baêta, D. ; MONTEIRO, J. P. C. ; LYRA, MARIANA L. ; ZAMUDIO, K. R. ; CHARITON, A. ; HADDAD, C. F. B. . Simultaneous Detection of Missing Amphibians and Their Fungal Pathogen in a Biodiversity Hotspot Using eDNA. Molecular Ecology , p. 000, 2025.
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ERNETTI, JULIA R. ; LOPES, CARLA MARTINS ; RIBEIRO, LUISA P. ; DE BASTIANI, VELUMA I.M. ; LUCAS, ELAINE M. ; TOLEDO, LUÍS FELIPE . Environmental DNA survey does not detect additional populations of a critically endangered leaf frog, but reveal another threat to the species. JOURNAL FOR NATURE CONSERVATION , v. 78, p. 126572, 2024.
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HADDAD, CÉLIO F.B. ; LOPES, CARLA M. ; BECKER, C. GUILHERME ; DA SILVA, FERNANDO R. ; LYRA, MARIANA L. . From genes to ecosystems: a synthesis of amphibian biodiversity research in Brazil. BIOTA NEOTROPICA (ONLINE. EDIÇÃO EM INGLÊS) , v. 22, p. e20221375, 2022.
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LOPES, C. M. ; Baêta, D. ; VALENTINI, A. ; LYRA, MARIANA L. ; SABAAG, A. F. ; GASPARINI, J. L. ; DEJEAN, T. ; HADDAD, C. F. B. ; ZAMUDIO, K. R. . Lost and found: frogs in a biodiversity hotspot rediscovered with environmental DNA. Molecular Ecology , v. 30, p. 3289-3298, 2021.
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RODRÍGUEZ'EZPELETA, NAIARA ; Zinger, Lucie ; KINZIGER, ANDREW ; BIK, HOLLY M. ; BONIN, AURÉLIE ; COISSAC, ERIC ; EMERSON, BRENT C. ; LOPES, CARLA MARTINS ; PELLETIER, TARA A. ; Taberlet, Pierre ; NARUM, SHAWN . Biodiversity monitoring using environmental DNA. MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES (ONLINE) , v. 21, p. 1405-1409, 2021.
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LOPES, CARLA MARTINS ; DE BARBA, MARTA ; BOYER, FRÉDÉRIC ; MERCIER, CÉLINE ; GALIANO, DANIEL ; KUBIAK, BRUNO BUSNELLO ; MAESTRI, RENAN ; DA SILVA FILHO, PEDRO JOEL SILVA ; GIELLY, LUDOVIC ; COISSAC, ERIC ; DE FREITAS, THALES RENATO OCHOTORENA ; Taberlet, Pierre . Ecological specialization and niche overlap of subterranean rodents inferred from DNA metabarcoding diet analysis. Molecular Ecology , v. 29, p. 3143-3153, 2020.
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LOPES, CARLA M. ; SASSO, THAIS ; VALENTINI, ALICE ; DEJEAN, TONY ; MARTINS, MARCIO ; ZAMUDIO, KELLY R. ; HADDAD, CÉLIO F. B. . eDNA metabarcoding: a promising method for anuran surveys in highly diverse tropical forests. Molecular Ecology Resources , p. 904-914, 2017.
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VENCES, MIGUEL ; LYRA, MARIANA L. ; PERL, R. G. BINA ; BLETZ, MOLLY C. ; STANKOVI', DAVID ; LOPES, CARLA MARTINS ; JAREK, MICHAEL ; BHUJU, SABIN ; GEFFERS, ROBERT ; HADDAD, CÉLIO F. B. ; STEINFARTZ, SEBASTIAN . Freshwater vertebrate metabarcoding on Illumina platforms using double-indexed primers of the mitochondrial 16S rRNA gene. Conservation Genetics Resources (Online) , v. 8, p. 1-5, 2016.
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LOPES, C. M. ; BARBA, M. ; BOYER, F. ; MERCIER, C. ; Filho, P.J.S.S. ; HEIDTMANN, L. M. ; GALIANO, D. ; KUBIAK, B. B. ; LANGONE, P. Q. ; GARCIAS, F. M. ; GIELY, L. ; COISSAC, E. ; FREITAS, T. R. O. ; TABERLET, P. . DNA metabarcoding diet analysis for species with parapatric vs sympatric distribution: a case study on subterranean rodents. Heredity (Edinburgh. Print) , v. 114, p. 525-536, 2015.
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FICETOLA, G. F. ; PANSU, J. ; BONIN, A. ; COISSAC, E. ; GIGUET-COVEX, C. ; BARBA, M. ; GIELY, L. ; LOPES, C. M. ; BOYER, F. ; POMPANON, F. ; RAYE, G. ; TABERLET, P. . Replication levels, false presences, and the estimation of presence / absence from eDNA metabarcoding data. Molecular Ecology Resources (Print) , v. 15, p. 543-556, 2014.
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LOPES, C. M. ; Zinger, Lucie ; VALDEMARIN, K. ; CARMO, D. ; TOLEDO, C. ; GUERRIERI, A. ; BOYER, F. ; COISSAC, E. ; TERRA, M. H. ; TABERLET, P. . Biodiversity assessment using cutting-edge technologies: where robotics meets molecular biology. In: 9th International Barcode of Life Conference, 2024, Belém. 9th International Barcode of Life Conference, 2024.
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TOLEDO, C. ; LOPES, C. M. ; VALDEMARIN, K. ; Zinger, Lucie ; VICENTINI, A. ; WERNECK, F. ; MARQUES, O. ; AMORIM, D. ; SOUZA, V. C. ; CARMO, D. ; GUERRIERI, A. ; COISSAC, E. ; TABERLET, P. . Increasing DNA reference databases for rapid species identification of plants, invertebrates and fishes in tropical forests: the XPRIZE-Rainforest experience. In: 9th International Barcode of Life Conference, 2024, Belém. 9th International Barcode of Life Conference, 2024.
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LOPES, C. M. ; COSTA, D. P. B. ; MONTEIRO, J. P. C. ; LYRA, MARIANA L. ; SABAAG, A. F. ; VALENTINI, A. ; SASSO, T. ; VANZETTI, A. ; SANTOS, M. T. T. ; GASPARINI, J. L. ; TABERLET, P. ; CHARITON, A. ; ZAMUDIO, K. R. ; HADDAD, C. F. B. . Latest news of environmental DNA metabarcoding approach for monitoring amphibian species in tropical forests. In: 9th World Congress of Herpetology, 2020, Dunedin. 9th World Congress of Herpetology, 2020.
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Lopes, C. M. ; BARBA, M. ; BOYER, F. ; MERCIER, C. ; Filho, P.J.S.S. ; HEIDTMANN, L. M. ; GALIANO, D. ; KUBIAK, B. B. ; LANGONE, P. Q. ; GARCIAS, F. M. ; GIELY, L. ; COISSAC, E. ; FREITAS, T. R. O. ; TABERLET, P. . DNA metabarcoding diet analysis for species with parapatric versus sympatric distribution: a case study on subterranean rodents. In: 60º Congresso brasileiro de genética, 2014, Guarujá. 60º Congresso brasileiro de genética, 2014.
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Lopes, C. M. ; BARBA, M. ; BOYER, F. ; MERCIER, C. ; Filho, P.J.S.S. ; HEIDTMANN, L. M. ; GALIANO, D. ; KUBIAK, B. B. ; LANGONE, P. Q. ; GARCIAS, F. M. ; GIELY, L. ; COISSAC, E. ; FREITAS, T. R. O. ; TABERLET, P. . DNA metabarcoding diet analysis in parapatric versus sympatric species distribution: a case study on subterranean rodents. In: DNA Watch. Using environmental and degraded DNA analysis to understand biodiversity, food webs and ecosystem functioning, 2013, Frasne. DNA Watch. Using environmental and degraded DNA analysis to understand biodiversity, food webs and ecosystem functioning, 2013. p. 1-39.
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LOPES, C. M. ; ALMEIDA, F. S. ; ORSI, M. L. ; BRITTO, S. G. C. ; SIROL, R. N. ; SODRE, L. M. K. . Análise da estrutura genética de Salminus brasiliensis (Pisces, Characiformes) no complexo Canoas - rio Paranapanema, como ferramenta de avaliação da eficiência das escadas de transposição de peixes.. In: 52° Congresso brasileiro de genética, 2006, Foz do Iguaçu. 52° Congresso brasileiro de genética, 2006.
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LOPES, C. M. ; FREITAS, T. R. O. . Estudos filogeográficos preliminares de Ctenomys minutus (Rodentia: Ctenomyidae) através da análise de uma seqüência da região controladora do DNAmt.. In: I Congresso Sul-Americano de Mastozoologia, 2006, Gramado. I Congresso Sul-Americano de Mastozoologia, 2006.
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LOPES, C. M. ; ALMEIDA, F. S. ; ORSI, M. L. ; BRITTO, S. G. C. ; SIROL, R. N. ; SODRE, L. M. K. . Estrutura Genética de Iheringichthys labrosus (Pisces, Pimelodidae) do Reservatório Capivara - Rio Paranapanema. In: 51° Congresso Brasileiro de Genética, 2005, Águas de Lindóia. Resumos do 51° Congresso Brasileiro de Genética, 2005.
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LOPES, C. M. ; ALMEIDA, F. S. ; ORSI, M. L. ; BRITTO, S. G. C. ; SODRE, L. M. K. . Análise Genética de Iheringichthys labrosus (Pisces, Pimelodidae) do Reservatório Capivara - Rio Paranapanema.. In: 50° Congresso Brasileiro de Genética, 2004, àguas de Lindóia. Resumos do 50° Congresso Brasileiro de Genética, 2004.
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LOPES, C. M. . DNA ambiental para o monitoramento da flora: o uso de novas tecnologias para solucionar velhos problemas. 2025. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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LOPES, C. M. ; Zinger, Lucie ; GUERRIERI, A. ; VALDEMARIN, K. ; TOLEDO, C. ; CARMO, D. ; MINOWA, A. ; BOYER, F. ; COISSAC, E. ; TABERLET, P. . Speeding up biodiversity assessment in tropical forests using (e/i)DNA (meta)barcoding approaches. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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LOPES, C. M. . Inovações em Biodiversidade (eDNA). 2025. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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LOPES, C. M. . Reference Databases. 2025. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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LOPES, C. M. . From molecules to species identification (eDNA). 2025. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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LOPES, C. M. ; BECKER, G. ; Baêta, D. ; MONTEIRO, J. P. C. ; LYRA, MARIANA L. ; ZAMUDIO, K. R. ; CHARITON, A. ; HADDAD, CÉLIO F. B. . eDNA reveals disappeared amphibians and fungal pathogen co-occurences in a biodiversity hotspot. 2024. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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LOPES, C. M. ; Zinger, Lucie ; VALDEMARIN, K. ; CARMO, D. ; TOLEDO, C. ; GUERRIERI, A. ; BOYER, F. ; COISSAC, E. ; TERRA, M. H. ; TABERLET, P. . Biodiversity assessment using cutting-edge technologies: where robotics meets molecular biology. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Lopes, C. M. . Filogenômica. 2024. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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Lopes, C. M. . DNA ambiental para o estudo de eucariontes no Brasil: passado, presente e futuro. 2023. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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Lopes, C. M. . Brazilian Team na competição XPrize rainforest. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Lopes, C. M. . Uso de DNA barcoding e metabarcoding (eDNA/iDNA) no reconhecimento das espécies. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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LOPES, C. M. . iDNA, eDNA, eRNA: o uso de amostras ambientais para o estudo da biodiversidade. 2023. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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LOPES, C. M. ; COSTA, D. P. B. ; MONTEIRO, J. P. C. ; LYRA, MARIANA L. ; SABAAG, A. F. ; SASSO, T. ; VANZETTI, A. ; SANTOS, M. T. T. ; CHARITON, A. ; ZAMUDIO, K. R. ; HADDAD, C. F. B. . eDNA of frogs in aquatic and soil ecosystems. 2022. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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LOPES, C. M. . What are the challenges we face to adopt eDNA as a mainstream approach for biodiversity monitoring?. 2022. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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LOPES, C. M. . DNA ambiental e conservação de anfíbios. 2022. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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LOPES, C. M. . DNA ambiental: o uso de novas tecnologias para decifrar velhos problemas. 2021. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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LOPES, C. M. . eDNA metabarcoding for detecting amphibian species in tropical forests. 2021. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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LOPES, C. M. . DNA ambiental para o monitoramento de anfíbios em florestas tropicais. 2021. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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LOPES, C. M. ; Baêta, D. ; MONTEIRO, J. P. C. ; LYRA, MARIANA L. ; SABAAG, A. F. ; VALENTINI, A. ; SASSO, T. ; VANZETTI, A. ; SANTOS, M. T. T. ; GASPARINI, J. L. ; TABERLET, P. ; CHARITON, A. ; ZAMUDIO, K. R. ; HADDAD, C. F. B. . Latest news of environmental DNA metabarcoding approach for monitoring amphibian species in tropical forests. 2020. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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LOPES, C. M. ; VALENTINI, A. ; DEJEAN, T. ; COSTA, D. P. B. ; HADDAD, C. F. B. ; ZAMUDIO, K. R. . The potential of eDNA metabarcoding for detecting locally extinct, missing, or declined amphibian species in tropical forests. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Lopes, C. M. . Onde está Wally? O DNA ambiental pode responder!. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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Lopes, C. M. . DNA ambiental: o uso de novas teconologias para decifrar velhos problemas. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Lopes, C. M. . Aplicações do DNA ambiental para o estudo de anfíbios. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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LOPES, C. M. . DNA ambiental na herpetologia e outras histórias. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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LOPES, C. M. . Genética e conservação de roedores. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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LOPES, C. M. ; BARBA, M. ; BOYER, F. ; MERCIER, C. ; Filho, P.J.S.S. ; HEIDTMANN, L. M. ; GALIANO, D. ; KUBIAK, B. B. ; LANGONE, P. Q. ; GARCIAS, F. M. ; GIELY, L. ; COISSAC, E. ; FREITAS, T. R. O. ; TABERLET, P. . DNA metabarcoding diet analysis for species with parapatric versus sympatric distribution: a case study on subterranean rodents. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Lopes, C. M. . DNA metabarcoding: o uso de novas tecnologias para decifrar velhos problemas. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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LOPES, C. M. . O uso de microssatélites em genética de populações: estudo de caso em Ctenomys minutus. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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LOPES, C. M. ; FERNANDEZ-STOLZ, G. P. ; FREITAS, T. R. O. . Abordagens multidisciplinares em conservação. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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LOPES, C. M. . Análise da estrutura genética de Salminus brasiliensis (Pisces, Characiformes) no complexo canoas ? rio Paranapanema, como ferramenta de avaliação das escadas de transposição de peixes. 2005. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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LOPES, C. M. ; MORALES, A. G. ; KAVATI, E. A. . Transcrição e Tradução. 2004. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).
Outras produções
LOPES, CM. . Assessoria pedagógica de conteúdo educacional. 2016.
LOPES, C. M. . Para mapear a biodiversidade da floresta. 2024. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
LOPES, C. M. . Brazilian frog believed ?extinct? for 50+ years, found with eDNA testing. 2020. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
LOPES, C. M. . DNA metabarcoding diet analysis for species with parapatric vs sympatric distribution: a case study on subterranean rodents. 2015. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
LOPES, C. M. ; TABERLET, P. ; COISSAC, E. ; BOYER, F. ; CHARITON, A. ; YAO, M. ; THOMSEN, P. F. ; PAGGI, G. M. . Metabarcodes of e/iDNA for Biodiversity Analysis and Monitoring. 2025. (Curso de curta duração ministrado/Outra).
LOPES, C. M. ; TABERLET, P. . DNA ambiental para o estudo de eucariontes (curso de aperfeiçamento ministrado). 2024. .
LOPES, C. M. ; DELGADO, D. B. ; MALAGOLI, L. R. ; BANDEIRA, L. N. ; CONSOLMAGNO, R. C. . DNA ambiental: o uso de novas tecnologias para decifrar velhos problemas. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Outra).
Projetos de pesquisa
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2025 - Atual
Com que rapidez a biodiversidade se recupera em florestas restauradas e como podemos medi-la efetivamente?, Descrição: Diante dos desafios climáticos e ambientais, as Nações Unidas declararam a Década da Restauração de Ecossistemas. O Brasil desempenha um papel crucial nesse contexto, especialmente por abrigar florestas tropicais como a Amazônica e a Atlântica, que lideram os índices de desmatamento global nas últimas décadas. O governo brasileiro tem renovado seu compromisso com a agenda internacional de conservação, voltada não apenas para o gerenciamento ambiental, mas também para a recuperação da biodiversidade. Nesse contexto, foram instituídos mecanismos de estímulo aos setores público e privado, como os créditos de biodiversidade, um ativo vinculado a investimentos em restauração ecológica e recuperação da biodiversidade. Entretanto, esse novo paradigma enfrenta desafios significativos, como a ausência de padronização em métricas e lacunas no conhecimento sobre como fatores ambientais influenciam a recuperação da biodiversidade em ecossistemas florestais tropicais. Visando reduzir incertezas e aumentar a previsibilidade nas medições, esta proposta de estudo busca, dentro das abordagens de tecnologia de monitoramento de comunidades biológicas em larga escala por meio do DNA ambiental (eDNA), investigar: Com que rapidez a biodiversidade se recupera em florestas restauradas e como podemos medi-la efetivamente? Serão utilizados dados de composição de comunidades biológicas obtidos por metabarcodificação de eDNA, coletado em áreas sob restauração ativa e passiva. Além disso, serão considerados dados ambientais locais e de paisagem, obtidos por meio de medições in situ, sensoriamento remoto e bases de dados ambientais. Índices de diversidade alfa, beta e zeta serão integrados em modelos estatísticos para identificar preditores ambientais da biodiversidade. O sucesso deste projeto contribuirá para o avanço na busca por métodos robustos de estimativa da biodiversidade, especialmente diante da heterogeneidade ambiental única da Floresta Atlântica, oferecendo subsídios e orientações para o setor público, bem como para iniciativas e empreendimentos que buscam demonstrar resultados tangíveis em restauração ecológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / Anderson Carvalho Vieira - Coordenador / Eduardo Mariano Neto - Integrante / Alesandro Souza Santos - Integrante / Deborah Faria - Integrante / Fernanda Amato Gaiotto - Integrante., Financiador(es): Instituto Serrapilheira - Auxílio financeiro.
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2023 - Atual
CBioClima - Centro de Pesquisas em Biodiversidade e Mudanças Climáticas, Descrição: A perda sem precedentes da biodiversidade e as ameaças iminentes das mudanças climáticas e ambientais estão entre os mais importantes desafios enfrentados pela humanidade. A biodiversidade continua diminuindo em todo o mundo, principalmente em resposta à expansão urbana e agrícola sobre áreas naturais. Além disso, as mudanças climáticas devem levar à extinção mais de um terço das espécies animais e vegetais da Terra até 2050, comprometendo a manutenção de muitos serviços ecossistêmicos essenciais para a sobrevivência humana. Portanto, a erosão da biodiversidade se traduz no desmoronamento da teia da vida, ameaçando as funções ecológicas que sustentam a própria existência da humanidade. Essa realidade construiu a ideia engajada de frear a perda de biodiversidade e prevenir mudanças drásticas nos climas, globais e regionais, como objetivos convergentes. Nós propomos um CEPID Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão - sobre Dinâmica da Biodiversidade e Mudanças Climáticas (CBioClima): um centro único e inovador que reúne especialistas em ciência, difusão e inovação para produzir pesquisas e soluções baseadas na natureza de classe global e de ponta, visando a perda de biodiversidade, seu sinergismo com as mudanças climáticas e as suas consequências para o bem-estar humano. Alinhado com os Objetivos de Desenvolvimento Sustentável (ODS) das Nações Unidas, proeminentemente 15 - Vida na Terra e 13 - Ação Climática, a missão do CBioClima é estabelecer um observatório de pesquisa sobre biodiversidade e mudanças climáticas, promover a inovação focada em soluções sustentáveis baseadas na ciência e acelerar a difusão do conhecimento, alinhada aos ODS 4 - Educação de Qualidade e 5 - Igualdade de Gênero. O Centro tornará o estado de São Paulo bem-posicionado para colaborar e trocar conhecimentos com os centros de biodiversidade e mudanças climáticas mais bem-sucedidos do mundo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / Célio F B Haddad - Integrante / Mauro Galleti - Integrante / Leonor Patricia Cerdeira Morellato - Coordenador / Clarisse Palma da Silva - Integrante / Leonardo Fernandes Fraceto - Integrante / Mauricio Bacci Junior - Integrante / Milton Cezar Ribeiro - Integrante / Vitor Fernandes Oliveira de Miranda - Integrante.
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2022 - 2023
Efeitos do fogo sobre a abundância e diversidade de vertebrados do Parque Nacional da Serra da Canastra, Descrição: Os incêndios florestais estão entre as principais causas da degradação ambiental e perda de biodiversidade. Dentre as ações de prevenção de incêndios, o Manejo Integrado do Fogo (MIF) ganha cada vez mais destaque no Brasil e no Mundo. O MIF envolve pesquisa e monitoramento dos efeitos do fogo sobre o ambiente, sociedade e biodiversidade, ordenamento do uso do fogo para manutenção cultural e sustentabilidade econômica, aliado ao uso do fogo como um fator ecológico fundamental em ecossistemas pirofíticos, como nos ambientes savânicos no Cerrado brasileiro. Neste sentido, este projeto visa avaliar os efeitos do fogo sobre a abundância e diversidade de fauna de vertebrados em três diferentes tratamentos que apresentam regimes de fogo distintos: 1) época de ocorrência; 2) tamanho de área queimada, e; 3) frequência e intensidade. Serão avaliados, os efeitos do fogo sobre diversidade, abundância e estrutura das comunidades de vertebrados, antes e após a ocorrência de incêndios, queimas prescritas e queimas controladas, considerando a escala temporal e as funções ecológicas e atributos funcionais das espécies. O levantamento de campo integra transectos lineares para busca ativa, armadilhamento fotográfico, bioacústica e DNA Ambiental. Os resultados serão primordiais para que consigamos contribuir para o monitoramento dos efeitos do fogo e para a tomada de decisão de uso ou não do fogo nas práticas de gestão de áreas protegidas, de conservação da biodiversidade e de prevenção de incêndios florestais.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / Ronaldo Gonçalves Morato - Coordenador / Christian Niel Berlinck - Integrante / Luanne Helena Augusto Lima - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
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2021 - 2022
Avaliação do impacto do fogo sobre a biodiversidade e o solo, contribuições para o estabelecimento do Manejo Integrado do Fogo no Pantanal, Descrição: O fogo é considerado um dos fatores que mais influencia a estrutura e as funções do ecossistema (Bowman et al. 2009), além de determinar a diversidade, estrutura e composição das comunidades biológicas (Whelan, 1997). O fogo pode ter origem natural, raios e vulcanismo, ou antrópica e ocorrer em todos os continentes. Desta forma, considerando a relação do ambiente com fogo, pode-se classificar em: dependentes, sensíveis, influenciados ou independentes (Hardesty et al., 2005; Myers, 2006). Especificamente para o Brasil, Pivello (2011) classifica o Bioma Pantanal como dependente de fogo, assim como o Cerrado e os Pampas. Em uma escala menor, cada fitofisionomia responde diferentemente a presença de fogo, algumas podem ser mais sensíveis como os ambientes florestais, outras mais adaptadas como os campos, portanto não existe uma estratégia de gestão do fogo única para todo o Pantanal (Berlinck e Batista, 2020). Neste contexto, 26 pesquisadores de diferentes instituições de pesquisa e ensino, aliados aos técnicos da SEMA e ICMBIO, estão focando esforços para analisar a distribuição temporal das espécies identificadas por DNA ambiental de acordo com a época de ocorrência de fogo para compreender a dinâmica ocupacional da biodiversidade e orientar decisões de manejo do fogo, além de implementar o banco de metabarcodings de mamíferos, répteis, anfíbios, artrópodes do solo e microbiota edáfica para que futuras avaliações de impacto possam ser realizadas de forma rápida, objetiva e escalonada. Paralelamente, o grupo avaliará o perfil químico e toxicológico das cinzas resultantes das queimadas em modelos estabelecidos. Uma das metas finais do projeto é fornecer subsídios à SEMA, e outros órgãos estaduais e federais, para fomentar políticas públicas e gestão dos recursos naturais sobe efeito do fogo no Pantanal. Assim, esta proposta objetiva analisar a distribuição temporal das espécies identificadas por DNA ambiental de acordo com a época de ocorrência de fogo para compreender a dinâmica ocupacional da biodiversidade e orientar decisões de manejo do fogo, além de implementar o banco de metabarcodings de mamíferos, répteis, anfíbios, artrópodes do solo e microbiota edáfica para que futuras avaliações de impacto possam ser realizadas de forma rápida, objetiva e escalonada.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / Leandro Dênis Battirola - Coordenador / Marcos Antonio Soares - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Mato Grosso - Auxílio financeiro.
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2021 - Atual
Ghostbusters searching for Phantasmarana bocainensis: the Data Deficient Bocaina big-tooth frog last seen in 1968, Descrição: The Brazilian Atlantic forest is distributed in the Brazilian coastline, and is considered one of the 25 global biodiversity hotspots in the world. The type locality (where our target species was originally found) is the Campo de Fruticultura (S22⁰43'53.0" W44⁰35'45.8", 1500 m above sea level, a.s.l.), at Serra da Bocaina, State of São Paulo, southeastern Brazil. The Campo de Fruticultura is located inside the National Park of Serra da Bocaina. The National Park has a total of 134.000 hectares, ranging from 0 to 2000 m a.s.l. The target species was collected in 1968 and has never been found ever since. However, in 2016, DNA traces putatively assigned to Phastasmarana bocainensis were found in the streams of the Campo de Fruticultura, given us some hope that the species is still alive and inhabiting the type locality. Our goal is to survey for P. bocainensis at the type locality, as well as adjacent suitable rivers and streams of mountainous regions at the National Park of Serra da Bocaina.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Carla Martins Lopes - Coordenador / Célio F B Haddad - Integrante / Délio Baêta - Integrante / Juliane P C Monteiro - Integrante., Financiador(es): The Mohamed bin Zayed species conservation fund - Auxílio financeiro.
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2014 - 2021
Abordagens genômicas a estudos de diversificação e conservação dos anfíbios brasileiros, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / Célio Fernando Baptista haddad - Coordenador / Kelly Raquel Zamudio - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
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2014 - 2020
Diversidade e conservação dos anfíbios brasileiros, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / Kelly Raquel Zamudio - Integrante / Célio F B Haddad - Coordenador / Julian Faivovich - Integrante / S Kasahara - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2012 - 2014
Análise da dieta de ctenomídeos baseada em DNA código de barras e pirosequenciamento: o uso de novas tecnologias para decifrar velhos problemas, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (2) . , Integrantes: Carla Martins Lopes - Coordenador / Thales Renato Ochotorena de Freitas - Integrante / Laura Moretti Heidtmann - Integrante / Pedro Joel Silva da Silva Filho - Integrante / Daniel Galiano - Integrante / Pierre Taberlet - Integrante / Bruno Busnello Kubiak - Integrante / Ilsi Iob Boldrini - Integrante / Patrícia Quintana Langone - Integrante / Felipe Maia Garcias - Integrante / Eric Coissac - Integrante / Ludovic Giely - Integrante / Marta de Barba - Integrante., Financiador(es): Agence Nationale de la Recherche - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
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2008 - 2011
Filogeografia, padrões de diversidade genética e polimorfismo de coloração em espécies de tuco-tucos (Rodentia: Ctenomyidae: Ctenomys) no sul do Brasil, Descrição: Desde 1979 vários trabalhos vem sendo desenvolvidos com Ctenomys no sul do Brasil, trabalhos esses que inicialmente descreveram a variabilidade cromossômica nas quatro espécies através de marcadores citogenéticos clássicos. Análises de zonas de hibridação entre e dentro espécies foram analisadas sob ponto vista morfológico, citogenético e com marcadores moleculares do tipo microssatélites. Atualmente, estão sendo determinados os padrões filogeográficos de Ctenomys minutus, C. torquatus e C. flamarioni. No entanto, novas informações sobre os padrões obtidos devem ser analisadas para a determinação de processos que melhor descrevam essa paisagem evolutiva. O presente projeto visa inicialmente determinar o padrão filogeográfico de C. lami a partir de loci mitocondrias (região controladora e citicromo B) e compará-lo ao de C. minutus espécie afim de C. lami, assim como fortalecer estes resultados através de loci de microssatélites. Além disso, novos marcadores devem ser somados, como o sistema MHC e genes de colaração, para a comparação sob o ponto de vista dos processos seletivos subjacentes, das espécies que habitam diferentes habitats na planície costeira do sul do Brasil.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / Thales Renato Ochotorena de Freitas - Coordenador / GABRIELA DE PAULA FERNÁNDEZ-STOLZ - Integrante / Simone Souza Freitas Ximenes - Integrante / Enrique Pablo Lessa - Integrante / Rodrigo Fornel - Integrante / José Francisco Bonini Stolz - Integrante / Gislene Lopes Gonçalves - Integrante / Tatiane Noviski - Integrante / Hopi Hoekstra - Integrante / Marlise Ladvocate Bartholomei Santos - Integrante / Pedro Cordeiro-Estrela - Integrante / Paula Angelica Roratto - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
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2008 - 2010
Padrões de variabilidade em genes do complexo-maior-de-histocompatibilidade (MHC) em duas espécies do gênero Ctenomys (Rodentia-Ctenomyidae): aplicações em estudos populacionais, filogeográficos e de conservação, Descrição: O estudo das características demográficas, dos padrões de distribuição da variabilidade genética, assim como dos fatores que contribuem com estes padrões, tal como a evolução geomorfológica da planície costeira, a instabilidade climática que caracteriza estes ambientes e as modificações produzidas pelo homem, contribuirá com a reconstrução do cenário evolutivo que levou a geração dos padrões genéticos observados no presente. A comparação dos padrões de variabilidade genética entre C. flamarioni e C. minutus oferece uma oportunidade ímpar de acessar o efeito das diferentes limitações quanto ao habitat requerido por estas espécies, assim como as diferentes histórias demográficas e de ocupação das áreas de ocorrência das mesmas, sobre os padrões de variação genética. Quando na comparação são levados em consideração os padrões obtidos tanto para loci neutros quanto para loci submetidos à seleção, podem ser levantadas hipóteses a respeito da importância relativa de processos evolutivos estocásticos (como a deriva genética) versus adaptativos (como a seleção natural), que em conjunto determinam a história e o destino evolutivo destas espécies. Finalmente, o presente estudo é de alta relevância por contribuir com a formulação de hipóteses evolutivas para uma espécie endêmica e ameaçada de extinção no Estado do Rio Grande do Sul, o tuco-tuco-das-dunas (Ctenomys flamarioni), e para uma outra, a qual se tem dados insuficientes para ser avaliado o seu estado de conservação (C. minutus).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / Thales Renato Ochotorena de Freitas - Coordenador / GABRIELA DE PAULA FERNÁNDEZ-STOLZ - Integrante / Enrique Pablo Lessa - Integrante / Tatiane Noviski - Integrante / Paula Angelica Roratto - Integrante / Tatiane Rech - Integrante / Aldo Vassallo - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
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2007 - 2011
História evolutiva de Ctenomys minutus e Ctenomys lami na planície costeira do Sul do Brasil (Rodentia, Ctenomyidae), Descrição: Ctenomys minutus e Ctenomys lami são roedores fossoriais que ocorrem na planície costeira do sul do Brasil. As duas espécies apresentam grande variabilidade cariotípica, com presença de zonas híbridas intra-específicas e uma zona de hibridação interespecífica. Serão analisados 14 loci de microssatélites e seqüências da região controladora do DNA mitocondrial das duas espécies e da zona híbrida interespecífica. Os dados obtidos serão relacionados com características geográficas da área de ocorrência e dados cariotípicos das duas espécies.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / Thales Renato Ochotorena de Freitas - Coordenador / Laura Moretti Heidtmann - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / FUNDACAO DE AMPARO A PESQUISA DO ESTADO DO RIO GRANDE DO SUL - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
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2006 - 2011
A planície costeira do Sul do Brasil: História evolutiva, geológia, e conservação de um ecossistema único, Descrição: O projeto tem a finalidade de entender a história geológica e biológica da planície costeira do sul do Brasil através de espécies vegetais, invertebrados marinhos e terrestres e vertebrados que ocorrem em especial na Barreira Holocênica. Contribuindo para o estabelecimento de políticas para a conservação da biota específica desta região. Assim as propostas desse projeto visam interpretar a estratigrafia e a evolução geológica dos trechos costeiros da Barreira IV restantes. Para isso será determinada a filogeografia comparada da região através do estudo de 20 espécies (animais, protistas e vegetais), utilizando marcadores moleculares nucleares e organelares. Examinar a concordância entre os padrões filogenéticos achados a partir dos dados moleculares e as barreiras geográficas existentes, isto é, analisar a efetividade das barreiras geográficas na diferenciação filogenética. Descrever possíveis descontinuidades populacionais ao longo do eixo norte/sul, relacionando-as com o passado geológico da região e com as atuais alterações causadas pela ação antropogênica. Fazer estimativas do tempo de divergência das principais linhagens encontradas. Descrever a composição e estrutura funcional da comunidade de aranhas e isópodos terrestres encontrados ao longo da primeira faixa de dunas da planície costeira do RS. Caracterizar de maneira qualitativa e semi-quantitativa as respectivas faunas locais das dunas. Descrever a relação entre a composição e abundância destas faunas com a vegetação encontrada junto às dunas. Avaliar o grau de interação de Allocosa brasiliensis (Araneae; Lycosidae), Balloniscus glaber (Crustacea; Baloniscidae) e Efflagitatus freudei (Coleoptera; Heteroceridae) com o ambiente de dunas, identificando as suas vulnerabilidades aos impactos naturais e antropogênicos e os efeitos destes sobre as populações locais de cada espécie. Estimar a capacidade de dispersão (fluxo gênico) de Allocosa brasiliensis, Balloniscus glaber e Efflagitatus freudei através de.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / Thales Renato Ochotorena de Freitas - Coordenador / Loreta Brandão de Freitas - Integrante / Aldo Mellender Araújo - Integrante., Financiador(es): FUNDACAO DE AMPARO A PESQUISA DO ESTADO DO RIO GRANDE DO SUL - Auxílio financeiro.
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2005 - 2005
Análise genética de especies de peixes migradoras através de marcadores moleculares, Descrição: Esse projeto tem como objetivo geral avaliar, através de marcadores moleculares a estrutura populacional de 5 espécies de peixes migradores nos Reservatórios de Canoas I e Canoas II (Rio Paranapanema), antes e após a piracema para verificar a efetividade das escadas de transposição de peixes, e apreservação de estoques naturais... , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / Fernanda Simões de Almeida - Integrante / Mário Luis Orsi - Integrante / Leda maria K. Sodré - Coordenador / Juliano Villas Boas Ramos - Integrante / Francine Matias de Paula - Integrante / Oscar Akio Shibatta - Integrante / Fernando Yuldi Ashicaga - Integrante / Mirian Tieko Nunes Tsuchiya - Integrante / Carla Bettin Pires - Integrante., Financiador(es): Agência Nacional de Energia Elétrica - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Duke Energy International - Geração Paranapanema - Auxílio financeiro / Universidade Estadual de Londrina - Cooperação / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
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2003 - 2004
Análise genética de espécies de peixes do reservatório capivara (UHE- Escola Mackenzie), Descrição: Este projeto tem como objetivo o estudo da variabilidade genética e estrutura populacional de espécies de peixes de quatro localidades do Reservatório Capivara (UHE Escola Mackenzie) localizado no rio Paranapanema.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / Fernanda Simões de Almeida - Integrante / Mário Luis Orsi - Integrante / Leda maria K. Sodré - Coordenador / Fernando Yuldi Ashicaga - Integrante / Angelo Brunelli Albertoni Laranjeira - Integrante / Karla Martins Kaneto - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Duke Energy International - Geração Paranapanema - Auxílio financeiro / Universidade Estadual de Londrina - Outra / Universidade Estadual de Londrina - Bolsa.
Projetos de desenvolvimento
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2019 - Atual
XPrize Rainforest, Descrição: XPRIZE Rainforest is a global 5-year, $10 million competition that convenes innovators and experts across disciplines, from conservationists and Indigenous scientists to engineers and roboticists. The winning team will develop novel technologies to rapidly and comprehensively survey rainforest biodiversity and use that data to improve our understanding of this complex ecosystem to benefit both biodiversity and forest communities. For the finals testing, teams must be able to survey 100 hectares of tropical rainforest in 24 hours and produce the most impactful real-time insights within 48 hours. Teams also need to demonstrate the scalability of their technology and maximize performance on biodiversity surveying and producing insights to meet the prize criteria and effectively disrupt the current biodiversity assessment landscape.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / Vinicius Castro Souza - Coordenador / Simone Dena - Integrante / Paulo Guilherme Molin - Integrante / Marco Henrique Terra - Integrante / Silvia Helena Galvão de Miranda - Integrante.
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2025 - Atual
O DNA da Amazônia Brasileira: identificação de espécies de madeiras comerciais impactadas pela CITES com base em ferramentas moleculares, Descrição: O presente projeto, intitulado O DNA da Amazônia Brasileira: identificação de espécies demadeiras comerciais impactadas pela CITES com base em ferramentas moleculares, tem comoprincipal objetivo desenvolver uma plataforma de soluções tecnológicas e científicas baseadas eminformação de DNA para tornar o sistema de identificação de espécies florestais no ManejoFlorestal Sustentável inquestionável, especialmente aquelas referidas e protegidas pela CITES(Convenção sobre o Comércio Internacional das Espécies Silvestres Ameaçadas de Extinção),impulsionando o mercado da madeira legal e, por consequência, inibindo e desvalorizando o mercado ilegal. Intrínseco a isso, o objetivo do projeto é que essa solução seja rápida (laudo em até 15 dias) e economicamente viável.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / David Escaquete - Coordenador / Fernanda B. Pereira - Integrante / Danielle Scotton - Integrante / Angelo Silvestre Saccaro - Integrante / Vitória Reis Werner - Integrante / Fábio Rodrigo de Freitas - Integrante / Gabriela Rua Sebastião - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Outra.
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2019 - Atual
XPrize Rainforest, Descrição: https://www.xprize.org/prizes/rainforesthttps://fealq.org.br/brazilianteam_rainforest/. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Carla Martins Lopes - Integrante / Vinicius Castro Souza - Coordenador / Simone Dena - Integrante / Paulo Guilherme Molin - Integrante / Marco Henrique Terra - Integrante / Silvia Helena Galvão de Miranda - Integrante.
Prêmios
2024
Terceira colocação na competição Xprize Rainforest (https://www.xprize.org/prizes/rainforest/finalist-teams), XPrize.
2016
Travel Grant - Annual Meeting of the Association for Tropical Biology and Conservation, Association for Tropical Biology and Conservation.
2015
Travel Grant - Congress of the European Society for Evolutionary Biology, European Society for Evolutionary Biology.
2013
Travel Grant - Programming for Evolutionary Biology Course, Universidade de Leipzig.
2010
Milton Krieger- Melhor trabalho em genética, evolução e melhoramento animal, Sociedade Brasileira de Genética.
2008
Melhor trabalho no XX salão de iniciação científica na sessão de genética animal, UFRGS.
Histórico profissional
Endereço profissional
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Genoma A Biotech Pesquisa e Desenvolvimento em Biologia ltda. , Rua Diácono Jair de Oliveira - de 1/2 a 99998/99999, Loteamento Santa Rosa, 13414155 - Piracicaba, SP - Brasil, Telefone: (19) 34294100
Experiência profissional
2025 - Atual
Genoma A Biotech Pesquisa e Desenvolvimento em Biologia ltda, Genoma A BiotechVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: SET-A, Carga horária: 40
2024 - Atual
Escola Superior de Agricultura Luiz de QueirozVínculo: Coordenadora, Enquadramento Funcional: Coordenadora de Grupo de Pesquisa, Carga horária: 10
Outras informações:
Coordenadora do grupo de DNA dentro do Brazilian Team (https://fealq.org.br/brazilianteam_rainforest/), no âmbito da competição XPrize Rainforest (https://www.xprize.org/prizes/rainforest)
2023 - 2025
Escola Superior de Agricultura Luiz de QueirozVínculo: Prestação de Serviço, Enquadramento Funcional: Coordenadora de grupo de pesquisa, Carga horária: 40
Outras informações:
Coordenadora do grupo de DNA dentro do Brazilian Team (https://fealq.org.br/brazilianteam_rainforest/), no âmbito da competição XPrize Rainforest (https://www.xprize.org/prizes/rainforest)
2022 - 2025
Escola Superior de Agricultura Luiz de QueirozVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Membro integrante do Brazilian Team, Carga horária: 40
2022 - 2024
Universidade de São PauloVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista DTI-A, Carga horária: 40
2014 - 2022
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita FilhoVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutoranda, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2018 - 2018
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita FilhoVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Monitoria, Carga horária: 60
Outras informações:
Auxiliar na disciplina condensada "Sistemática de Anfíbios" para o Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas - Zoologia, da UNESP Rio Claro.
Atividades
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05/2014 - 06/2022
Pesquisa e desenvolvimento, Campus Experimental de Rio Claro - SP.Linhas de pesquisa
2019 - 2020
Macquarie UniversityVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio de pós-doutoramento no exterior, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2018 - 2018
Université Joseph Fourier - Grenoble IVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio de pós-doutoramento no exterior, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2012 - 2013
Université Joseph Fourier - Grenoble IVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutoranda, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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01/2012 - 12/2013
Pesquisa e desenvolvimento, Laboratoire d?Ecologie Alpine (LECA).Linhas de pesquisa
2014 - 2014
Centre National de la Recherche ScientifiqueVínculo: , Enquadramento Funcional: Pesquisadora, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
Contrato de duração determinada (CDD), para o período de 01/2014 a 03/2014.
2007 - 2011
Universidade Federal do Rio Grande do SulVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante de Doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2006 - 2007
Universidade Federal do Rio Grande do SulVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante de Mestrado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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03/2006 - 12/2011
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Biociências, Departamento de Genética.Linhas de pesquisa
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11/2010 - 11/2010
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Genética da Conservação (BIO 07034)
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05/2007 - 05/2007
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Evolução Biológica (BIO 07003)
2006 - 2013
ONG Mamíferos RSVínculo: Associada, Enquadramento Funcional: Sócia colaboradora
Atividades
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06/2009 - 07/2013
Direção e administração, ONG Mamíferos RS.Cargo ou função, Diretora administrativa.
2003 - 2005
Universidade Estadual de LondrinaVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20
2001 - 2005
Universidade Estadual de LondrinaVínculo: Estudante de Graduação, Enquadramento Funcional: Estudante de Graduação, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2002 - 2003
Universidade Estadual de LondrinaVínculo: Voluntária, Enquadramento Funcional: Estagiária, Carga horária: 10
Atividades
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03/2005 - 12/2005
Estágios , Centro de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Geral.Estágio realizado, Análise Genética de Especies de Peixes Migradoras através de Marcadores Moleculares.
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05/2003 - 12/2005
Pesquisa e desenvolvimento, Centro de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Geral.Linhas de pesquisa
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05/2003 - 12/2004
Estágios , Centro de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Geral.Estágio realizado, Análise Genética de Espécies de Peixes do Reservatório Capivara (UHE- Escola Mackenzie).
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03/2002 - 03/2003
Estágios , Centro de Ciências Biológicas, Departamento de Microbiologia.Estágio realizado, Estudo da resposta imune em frangos após a imunização com antígenos fimbriais e de membrana de amostras de Escherichia coli aviária incorporados a complexos imuno-estimulantes ISCOMS.
2021 - 2022
Universidade Federal de Mato GrossoVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisadora colaboradora
2022 - 2024
Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade, ICMBioVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisadora colaboradora
2025 - Atual
Universidade Federal da BahiaVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisadora Colaboradora
Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todos os processos de Carla Martins Lopes e sempre que o nome aparecer em publicações dos Diários Oficiais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todas as movimentações desse processo e sempre que o processo aparecer em publicações dos Diários Oficiais e nos Tribunais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
Confirma a exclusão?